151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1857 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  76.22 
 
 		 1459 aa  1189    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1322 aa  2471    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  75.92 
 
 		 1458 aa  1185    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  29.43 
 
 		 1119 aa  224  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  34.8 
 
 		 1172 aa  222  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  40.64 
 
 		 1111 aa  220  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  37.99 
 
 		 1130 aa  194  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  32.78 
 
 		 2711 aa  192  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.96 
 
 		 1694 aa  189  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  34.48 
 
 		 1550 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  37.21 
 
 		 2906 aa  186  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  34.38 
 
 		 2396 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.51 
 
 		 1227 aa  185  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.32 
 
 		 3629 aa  183  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  39.15 
 
 		 1530 aa  182  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  44.6 
 
 		 2407 aa  179  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.37 
 
 		 1532 aa  171  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  42.16 
 
 		 1741 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  32.04 
 
 		 3954 aa  163  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  37.5 
 
 		 1971 aa  161  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.8 
 
 		 1081 aa  154  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  32.01 
 
 		 4238 aa  151  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  29.13 
 
 		 1782 aa  149  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1881 aa  147  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  32.05 
 
 		 2365 aa  147  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  32.01 
 
 		 2346 aa  146  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  36.99 
 
 		 1508 aa  142  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  31.91 
 
 		 2371 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4484  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000859006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.25 
 
 		 1029 aa  127  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  43.36 
 
 		 2366 aa  126  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.23 
 
 		 1285 aa  125  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  36.66 
 
 		 2578 aa  125  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  28.76 
 
 		 2003 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.08 
 
 		 1848 aa  122  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  38.14 
 
 		 1882 aa  121  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  35.97 
 
 		 3506 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  29.64 
 
 		 3322 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  38.79 
 
 		 861 aa  112  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  29.54 
 
 		 995 aa  111  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  26.51 
 
 		 1001 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.62 
 
 		 1489 aa  109  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  26.71 
 
 		 1333 aa  107  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  34.16 
 
 		 950 aa  106  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  43.25 
 
 		 1861 aa  105  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  28.46 
 
 		 1066 aa  104  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  35.64 
 
 		 1180 aa  101  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  31.07 
 
 		 2057 aa  98.2  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  42.27 
 
 		 1593 aa  97.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  28.6 
 
 		 986 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  27.6 
 
 		 983 aa  96.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  43.79 
 
 		 1113 aa  95.1  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27.51 
 
 		 1004 aa  94.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  27 
 
 		 1519 aa  94.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  41.18 
 
 		 1571 aa  93.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  44.58 
 
 		 3420 aa  92.8  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  44.58 
 
 		 3415 aa  92.4  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  26.33 
 
 		 1028 aa  92  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  48.11 
 
 		 2926 aa  90.9  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  26.35 
 
 		 1055 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.69 
 
 		 991 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.24 
 
 		 1769 aa  88.2  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.98 
 
 		 919 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  26.24 
 
 		 990 aa  86.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.95 
 
 		 1125 aa  86.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  41.35 
 
 		 4238 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  41.44 
 
 		 1164 aa  85.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  26 
 
 		 1038 aa  85.5  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  41.35 
 
 		 3822 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  25.78 
 
 		 995 aa  85.5  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  25.93 
 
 		 1001 aa  85.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  27.29 
 
 		 1033 aa  84.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.33 
 
 		 1011 aa  83.2  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  40.11 
 
 		 882 aa  78.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  33.18 
 
 		 1325 aa  78.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 		 816 aa  77  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  36.21 
 
 		 987 aa  76.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.97 
 
 		 3089 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  38.5 
 
 		 1093 aa  75.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  38.5 
 
 		 1093 aa  75.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  30.89 
 
 		 852 aa  75.1  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  29.95 
 
 		 1806 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  30.2 
 
 		 1626 aa  73.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  39.02 
 
 		 965 aa  73.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  38.29 
 
 		 1068 aa  71.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  24.71 
 
 		 2848 aa  70.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1446 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1165 aa  68.2  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1165 aa  68.2  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  34.84 
 
 		 1019 aa  67.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  40.27 
 
 		 677 aa  67.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  36.92 
 
 		 909 aa  67.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  32.39 
 
 		 1632 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  36.25 
 
 		 1108 aa  67.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  49.5 
 
 		 2363 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  35.62 
 
 		 1099 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  25.29 
 
 		 907 aa  66.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.69 
 
 		 1806 aa  65.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  27.49 
 
 		 1016 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  39.39 
 
 		 970 aa  63.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>