More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3305 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4178  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.21 
 
 
1064 aa  738  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5072  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.45 
 
 
1062 aa  802  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193812  normal  0.0596255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1563  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.36 
 
 
1061 aa  739  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0482838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1350  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.06 
 
 
1063 aa  748  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.89 
 
 
1040 aa  850  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4788  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.98 
 
 
1062 aa  1256  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3044  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.18 
 
 
1075 aa  744  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173145  normal  0.334092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2437  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.45 
 
 
1065 aa  765  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2447  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.51 
 
 
1059 aa  785  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3817  multidrug resistance protein MdtF  40.1 
 
 
1037 aa  731  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0885908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2616  aminoglycoside/multidrug efflux system  38.59 
 
 
1037 aa  733  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.935344  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1207  aminoglycoside/multidrug efflux system  38.88 
 
 
1037 aa  738  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0203  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.1 
 
 
1037 aa  729  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.115131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3208  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40 
 
 
1050 aa  731  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1382  aminoglycoside/multidrug efflux system  40.17 
 
 
1043 aa  737  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.81 
 
 
1049 aa  754  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.40035  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.19 
 
 
1047 aa  768  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6557  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.38 
 
 
1063 aa  773  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169266  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4919  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.69 
 
 
1061 aa  805  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462641  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5538  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.68 
 
 
1057 aa  751  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300706  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3746  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.07 
 
 
1050 aa  756  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756771  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4224  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.87 
 
 
1068 aa  786  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5850  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  53.5 
 
 
1043 aa  1052  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.645492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4535  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.54 
 
 
1061 aa  776  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736092  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4149  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.16 
 
 
1055 aa  783  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3912  multidrug resistance protein MdtF  40.1 
 
 
1037 aa  727  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.149985  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2042  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.65 
 
 
1071 aa  750  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.798214  normal  0.0985103 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5504  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.71 
 
 
1089 aa  773  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.12 
 
 
1061 aa  776  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730926  normal  0.35721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0648  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.6 
 
 
1089 aa  773  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3092  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.22 
 
 
1056 aa  733  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185291  normal  0.0905875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0901  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.46 
 
 
1062 aa  822  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629732  normal  0.563916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3813  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.49 
 
 
1057 aa  766  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353307  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5229  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.4 
 
 
1066 aa  800  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.536808  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4670  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.33 
 
 
1063 aa  773  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3713  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.82 
 
 
1058 aa  753  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1087  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.02 
 
 
1059 aa  775  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5122  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.32 
 
 
1072 aa  778  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2510  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.7 
 
 
1059 aa  789  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307051  normal  0.508426 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1639  multidrug resistance protein MdtF  39.67 
 
 
1041 aa  760  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0267869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4000  multidrug resistance protein MdtF  40.2 
 
 
1037 aa  731  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2749  aminoglycoside/multidrug efflux system  38.59 
 
 
1037 aa  733  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3716  multidrug resistance protein MdtF  40.1 
 
 
1037 aa  729  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2599  aminoglycoside/multidrug efflux system  38.79 
 
 
1037 aa  738  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.27 
 
 
1059 aa  829  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0514  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  61.44 
 
 
1069 aa  1305  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0319  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.36 
 
 
1079 aa  749  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0714  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.57 
 
 
1069 aa  746  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1775  acriflavine resistance protein B  38.58 
 
 
1051 aa  743  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00032562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0564  AcrB protein  38.43 
 
 
1054 aa  762  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00145035  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3068  acriflavine resistance protein B  40 
 
 
1050 aa  731  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.24086e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1268  aminoglycoside/multidrug efflux system  40.17 
 
 
1043 aa  737  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0668  RND efflux transporter  41.9 
 
 
1039 aa  758  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1591  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  39.92 
 
 
1040 aa  782  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0568  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.61 
 
 
1054 aa  746  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486962  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1256  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.1 
 
 
1038 aa  832  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.393229  normal  0.26342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2284  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 
1055 aa  739  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.87 
 
 
1048 aa  761  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26926  hitchhiker  0.00468273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4508  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.56 
 
 
1069 aa  772  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229715  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4359  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.29 
 
 
1064 aa  743  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.96 
 
 
1063 aa  764  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2879  multidrug efflux protein  40 
 
 
1050 aa  731  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.985137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2796  aminoglycoside/multidrug efflux system  40.17 
 
 
1085 aa  737  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.174051  normal  0.16394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3931  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.62 
 
 
1057 aa  759  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3374  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.5 
 
 
1061 aa  803  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.34 
 
 
1046 aa  740  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194313  normal  0.0197837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5136  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.63 
 
 
1102 aa  775  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.891075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0500  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.08 
 
 
1051 aa  757  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0164  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.04 
 
 
1064 aa  754  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.780381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4384  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.81 
 
 
1044 aa  743  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3324  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.64 
 
 
1052 aa  787  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2193  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.3 
 
 
1044 aa  744  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1151  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44 
 
 
1043 aa  845  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3700  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.6 
 
 
1033 aa  729  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4054  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.12 
 
 
1057 aa  835  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.422503  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10063  putative AcrB/AcrD family RND transport protein  38.57 
 
 
1049 aa  730  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.133163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2511  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.73 
 
 
1052 aa  731  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4334  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.87 
 
 
1068 aa  786  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26619  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3423  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.07 
 
 
1050 aa  755  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3809  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  64.02 
 
 
1056 aa  1288  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0639553  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3366  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.63 
 
 
1062 aa  825  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0201859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3352  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.02 
 
 
1066 aa  783  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176726  hitchhiker  0.00729316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.14 
 
 
1050 aa  732  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2563  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.2 
 
 
1091 aa  810  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44060  multidrug efflux pump HAE1-family transporter protein  41.18 
 
 
1069 aa  771  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.447353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33870  Multidrug efflux RND transporter MexF  41.98 
 
 
1057 aa  810  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1560  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  40.37 
 
 
1040 aa  764  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1153  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.94 
 
 
1058 aa  799  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328718  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0942  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.01 
 
 
1077 aa  801  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.26246  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.58 
 
 
1066 aa  810  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6915  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.75 
 
 
1062 aa  743  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5361  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.14 
 
 
1062 aa  808  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02323  hypothetical protein  38.88 
 
 
1037 aa  738  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03315  hypothetical protein  40.1 
 
 
1037 aa  729  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3048  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.11 
 
 
1047 aa  736  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0601242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2886  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  51.06 
 
 
1065 aa  1030  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.418369  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2295  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.14 
 
 
1122 aa  855  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2294  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.88 
 
 
1102 aa  845  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1920  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.44 
 
 
1044 aa  737  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0960887  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6591  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.46 
 
 
1072 aa  732  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.490488  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>