More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1779 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 444 aa  852    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  29.62 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  32.66 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  32.31 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  26.94 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 438 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  26.85 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  27.82 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 		 473 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 		 473 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 447 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 433 aa  103  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  27.62 
 
 		 493 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  27.91 
 
 		 501 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1470 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 437 aa  99.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  28.6 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  27.95 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 419 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 455 aa  96.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  26.59 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  29.34 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  29.34 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 439 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 467 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 458 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.44 
 
 		 471 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  26.85 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  28.74 
 
 		 426 aa  87.4  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  27.98 
 
 		 517 aa  86.7  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 		 467 aa  86.7  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 587 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.29 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  28.35 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  26.9 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.4 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.83 
 
 		 1496 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.21 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.75 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.06 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  27.36 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  18.96 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.81 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.98 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.2 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 515 aa  77.8  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.08 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  27.7 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 525 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 738 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.1 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  27.79 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.36 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.53 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.76 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  26.9 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>