239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1527 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  63.39 
 
 		 877 aa  862    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  65.95 
 
 		 884 aa  988    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  55.45 
 
 		 855 aa  722    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  100 
 
 		 867 aa  1674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  68.39 
 
 		 868 aa  1000    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  54.3 
 
 		 866 aa  729    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  68.76 
 
 		 857 aa  1021    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  63.04 
 
 		 877 aa  856    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  57.85 
 
 		 844 aa  775    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  54.49 
 
 		 853 aa  674    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  42.97 
 
 		 855 aa  556  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  42.69 
 
 		 858 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  42.48 
 
 		 846 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  41.91 
 
 		 857 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 835 aa  347  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  36.81 
 
 		 835 aa  347  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  41.28 
 
 		 408 aa  237  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.5 
 
 		 849 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  42.15 
 
 		 445 aa  220  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  26.34 
 
 		 858 aa  217  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.33 
 
 		 850 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 		 839 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.53 
 
 		 855 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 		 847 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 847 aa  168  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.24 
 
 		 870 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 		 845 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.31 
 
 		 850 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.22 
 
 		 843 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 849 aa  137  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.56 
 
 		 851 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 		 852 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 		 848 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  24.45 
 
 		 845 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  23.64 
 
 		 889 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  29.6 
 
 		 866 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 		 884 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  21.9 
 
 		 817 aa  101  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  23.58 
 
 		 889 aa  101  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 846 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.97 
 
 		 847 aa  100  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 		 849 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  22.64 
 
 		 879 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  31.05 
 
 		 841 aa  97.8  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  31.36 
 
 		 842 aa  97.8  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.02 
 
 		 842 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  25.76 
 
 		 820 aa  91.3  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.6 
 
 		 843 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  27.18 
 
 		 843 aa  89.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 837 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  21.79 
 
 		 817 aa  88.6  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  29.94 
 
 		 842 aa  87.8  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  31.5 
 
 		 842 aa  87.8  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  23.55 
 
 		 887 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  24.09 
 
 		 858 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  21.32 
 
 		 878 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  23.09 
 
 		 897 aa  84  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  23.14 
 
 		 889 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  21.31 
 
 		 836 aa  81.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  28.99 
 
 		 857 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  22.81 
 
 		 887 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 		 800 aa  79.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 		 853 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  24.51 
 
 		 820 aa  77.4  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  21.11 
 
 		 865 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  24.56 
 
 		 821 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.5 
 
 		 841 aa  75.1  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  21.78 
 
 		 836 aa  74.7  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  23.37 
 
 		 856 aa  74.3  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 		 821 aa  74.3  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  25.83 
 
 		 856 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  23.46 
 
 		 855 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  33.18 
 
 		 834 aa  72.4  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  25.21 
 
 		 815 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  28.21 
 
 		 819 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  27.41 
 
 		 795 aa  68.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.36 
 
 		 845 aa  67  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  27.43 
 
 		 819 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  32.24 
 
 		 871 aa  65.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  23.98 
 
 		 826 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  28.99 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  18.68 
 
 		 833 aa  65.1  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  32.43 
 
 		 817 aa  64.7  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.62 
 
 		 414 aa  64.3  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  21.7 
 
 		 850 aa  63.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  24.19 
 
 		 793 aa  62.4  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 855 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  26.42 
 
 		 821 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  25.38 
 
 		 819 aa  62  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  26.93 
 
 		 819 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.45 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 930 aa  61.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  22.44 
 
 		 849 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  23.73 
 
 		 825 aa  59.3  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 873 aa  58.9  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  25.54 
 
 		 827 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.49 
 
 		 880 aa  58.2  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 		 845 aa  57.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.32 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  20.95 
 
 		 836 aa  57.8  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>