More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0047 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  100 
 
 		 397 aa  806    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  56.3 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  34.88 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  31.39 
 
 		 505 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  32.07 
 
 		 524 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  30.4 
 
 		 530 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  28.72 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  31.27 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  34.43 
 
 		 503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  31.27 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  34.73 
 
 		 417 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30.67 
 
 		 640 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.44 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  28.81 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  27.65 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  27.72 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  31.31 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  26.12 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  31.16 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  28.52 
 
 		 328 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  25.77 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  28.61 
 
 		 374 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  29.49 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.24 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  26.87 
 
 		 305 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  29.26 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  28.47 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  25.09 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  29.49 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.85 
 
 		 305 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  25.09 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  25.09 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  28.2 
 
 		 366 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  27.37 
 
 		 467 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  29.69 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  30.07 
 
 		 468 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  25.09 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  28.72 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  25.41 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  28.38 
 
 		 313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  25.55 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.52 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  26.73 
 
 		 466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.7 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.93 
 
 		 598 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  26.76 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  28.19 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.09 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  28.52 
 
 		 315 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  29.14 
 
 		 327 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  29.82 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  28.53 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  30.55 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.58 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  30.91 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  27.09 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  27.09 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  26.69 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  26.69 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  28.77 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.76 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  27.64 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  29.23 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  27.4 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.7 
 
 		 476 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  27.34 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  28.44 
 
 		 372 aa  106  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  30.51 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  29.33 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  30.77 
 
 		 459 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  26.09 
 
 		 481 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  30.47 
 
 		 491 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  29.38 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  29.74 
 
 		 432 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.97 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  27.01 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  30.22 
 
 		 475 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  28.15 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  25 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.53 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.48 
 
 		 405 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  26.07 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.1 
 
 		 308 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  26.14 
 
 		 416 aa  98.2  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  30.77 
 
 		 340 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  23.17 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.44 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  28.52 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  28.87 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  29.13 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.85 
 
 		 449 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  24.16 
 
 		 309 aa  93.2  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  29.89 
 
 		 304 aa  92.8  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  27.16 
 
 		 504 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  27.94 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  25.09 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  27.05 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  28.87 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  26.45 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  26.87 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>