104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1394 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  80.98 
 
 		 184 aa  321  4e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  64.48 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  62.43 
 
 		 181 aa  254  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  60.56 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  59.78 
 
 		 181 aa  241  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  57.78 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  56.59 
 
 		 183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  53.55 
 
 		 188 aa  217  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  56.93 
 
 		 151 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.96 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  46.7 
 
 		 191 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  36.81 
 
 		 190 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.29 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  35.52 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  35.91 
 
 		 219 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  39.05 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  36.07 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  34.81 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  33.7 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  34.1 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  35.16 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.61 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.68 
 
 		 186 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.68 
 
 		 186 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.88 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.07 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  34.88 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  33.52 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  32.04 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  28.73 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  28.89 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.57 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  36.05 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.37 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  32.18 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.18 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.89 
 
 		 178 aa  87.8  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.14 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.46 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.16 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  29.89 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.91 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  28.83 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.51 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.13 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.29 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.14 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.7 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  28.22 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  26.86 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.29 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  29.21 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  27.67 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.66 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  31.9 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.11 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  24.71 
 
 		 225 aa  72  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.03 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.61 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  28.39 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.67 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  28.66 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.14 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  28.22 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.63 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  26 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.26 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.45 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  26.49 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  28.25 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  24.56 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.22 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  27.22 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  27.22 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.6 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  27.81 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  25.14 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  26.32 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  26.35 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.81 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  23.87 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.59 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.74 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.03 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.62 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.17 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  26.11 
 
 		 409 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  23.18 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0517  hypothetical protein  27.78 
 
 		 86 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.5 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  25.9 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.9 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.01 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  20.71 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.86 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.9 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  22.58 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>