More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0027 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 585 aa  1187    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  51.14 
 
 		 565 aa  535  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  49.91 
 
 		 564 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  48.51 
 
 		 572 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  49.91 
 
 		 563 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  47.45 
 
 		 556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  44.53 
 
 		 582 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 		 553 aa  333  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 		 550 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 		 557 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 		 555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  34.69 
 
 		 566 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  35.1 
 
 		 550 aa  298  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  33.83 
 
 		 569 aa  294  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 		 545 aa  282  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  33.27 
 
 		 540 aa  268  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  36.91 
 
 		 538 aa  246  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  40.12 
 
 		 515 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  39.52 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  39.52 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  39.52 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  39.82 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  39.82 
 
 		 513 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  41.3 
 
 		 463 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  41.62 
 
 		 521 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  41.62 
 
 		 524 aa  233  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  41.62 
 
 		 524 aa  233  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  41.62 
 
 		 524 aa  233  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  41.62 
 
 		 524 aa  233  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  40.94 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  41.62 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  41.62 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  41.62 
 
 		 524 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  38.39 
 
 		 471 aa  233  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  38.53 
 
 		 522 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  39.69 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  39.22 
 
 		 515 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  38.53 
 
 		 526 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  38.53 
 
 		 530 aa  231  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  33.11 
 
 		 552 aa  230  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  40.12 
 
 		 449 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  38.8 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  40.25 
 
 		 441 aa  228  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  39.43 
 
 		 432 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.75 
 
 		 452 aa  227  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  37.99 
 
 		 442 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 428 aa  226  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  38.76 
 
 		 443 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 		 443 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 441 aa  225  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  37.24 
 
 		 440 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  38.67 
 
 		 477 aa  225  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  35.71 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  37.01 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  41.51 
 
 		 436 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  38.63 
 
 		 426 aa  224  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  41.51 
 
 		 436 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.96 
 
 		 444 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.43 
 
 		 446 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  40.69 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  38.49 
 
 		 439 aa  223  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  38.86 
 
 		 472 aa  223  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  36.18 
 
 		 440 aa  223  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  37.71 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 		 440 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 		 440 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  33.49 
 
 		 440 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  36.86 
 
 		 444 aa  221  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 		 456 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  37.71 
 
 		 424 aa  220  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 498 aa  219  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  38.18 
 
 		 477 aa  219  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  36.93 
 
 		 445 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  37.96 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  35.83 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  37.96 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 		 451 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  35.6 
 
 		 440 aa  218  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 445 aa  217  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  34.31 
 
 		 556 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 		 429 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  35.6 
 
 		 440 aa  218  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  40.13 
 
 		 507 aa  217  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  35.89 
 
 		 451 aa  217  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  35.09 
 
 		 449 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  39.56 
 
 		 445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  37.64 
 
 		 434 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 		 445 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 		 444 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  32.69 
 
 		 468 aa  216  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  35.5 
 
 		 446 aa  216  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>