228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1153 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  57.35 
 
 		 855 aa  756    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  57.24 
 
 		 853 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  68.76 
 
 		 867 aa  1009    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  80.6 
 
 		 868 aa  1228    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  58.12 
 
 		 866 aa  767    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  100 
 
 		 857 aa  1654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  63.46 
 
 		 877 aa  863    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  62.09 
 
 		 844 aa  837    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  69.91 
 
 		 884 aa  1060    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  63.39 
 
 		 877 aa  875    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  43.71 
 
 		 855 aa  572  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  43.29 
 
 		 858 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  43.53 
 
 		 846 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  43.44 
 
 		 857 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  37.89 
 
 		 835 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  37.89 
 
 		 835 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  29.65 
 
 		 849 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  45.15 
 
 		 408 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  46.34 
 
 		 445 aa  233  9e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.78 
 
 		 858 aa  223  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  29.3 
 
 		 850 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  30.63 
 
 		 843 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.49 
 
 		 866 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.69 
 
 		 870 aa  175  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 847 aa  173  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.05 
 
 		 855 aa  168  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 		 847 aa  168  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.8 
 
 		 850 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.37 
 
 		 851 aa  154  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  23.16 
 
 		 817 aa  120  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.43 
 
 		 842 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  32.83 
 
 		 842 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  32.83 
 
 		 842 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 		 846 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  22.99 
 
 		 845 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 		 839 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.2 
 
 		 842 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  22.63 
 
 		 817 aa  108  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  21.57 
 
 		 817 aa  105  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 		 849 aa  105  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 		 849 aa  104  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  22.45 
 
 		 878 aa  103  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.76 
 
 		 847 aa  102  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  21.26 
 
 		 879 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  31.75 
 
 		 841 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  21.17 
 
 		 889 aa  101  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.19 
 
 		 843 aa  99.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  21.75 
 
 		 897 aa  98.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  22.32 
 
 		 836 aa  99  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  22.88 
 
 		 889 aa  98.6  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  22.54 
 
 		 887 aa  99  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 		 837 aa  98.6  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.08 
 
 		 855 aa  98.2  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  21.13 
 
 		 889 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  20.9 
 
 		 884 aa  95.9  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  21.44 
 
 		 865 aa  95.5  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  22.59 
 
 		 887 aa  94  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  21.66 
 
 		 836 aa  91.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  29.45 
 
 		 843 aa  89.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 845 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.69 
 
 		 841 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.6 
 
 		 852 aa  85.9  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 		 848 aa  84.7  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 		 855 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  21.82 
 
 		 836 aa  84.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  22.38 
 
 		 849 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  28.57 
 
 		 858 aa  82  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  27.2 
 
 		 857 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 855 aa  79.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 		 839 aa  79  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  28.94 
 
 		 795 aa  77  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.05 
 
 		 849 aa  75.1  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  29.03 
 
 		 819 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  29 
 
 		 819 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  25.34 
 
 		 856 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  26.28 
 
 		 821 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 		 800 aa  72  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 		 821 aa  71.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 834 aa  70.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  29.07 
 
 		 819 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 		 803 aa  70.1  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  27.19 
 
 		 800 aa  70.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  25 
 
 		 815 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  24.24 
 
 		 793 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  27 
 
 		 820 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  28.74 
 
 		 820 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  25.38 
 
 		 821 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  23.46 
 
 		 850 aa  66.6  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.21 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.41 
 
 		 825 aa  65.1  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.33 
 
 		 836 aa  65.1  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  25.9 
 
 		 826 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  28.57 
 
 		 795 aa  62.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  29.43 
 
 		 795 aa  62.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 		 930 aa  62.4  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  25 
 
 		 804 aa  61.2  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 		 846 aa  61.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  23.74 
 
 		 825 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  25.38 
 
 		 819 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  25.07 
 
 		 840 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>