More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0055 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  100 
 
 
332 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  64.73 
 
 
331 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  61.61 
 
 
328 aa  350  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  53.89 
 
 
346 aa  333  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  53.27 
 
 
342 aa  319  5e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  40.27 
 
 
366 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  41.5 
 
 
372 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  41.06 
 
 
347 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 
368 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 
366 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  39.83 
 
 
366 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  40.45 
 
 
375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  39.83 
 
 
374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  38.51 
 
 
375 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  37.07 
 
 
359 aa  215  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  40.66 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 
370 aa  212  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  39.27 
 
 
347 aa  212  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  36.52 
 
 
401 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  36.95 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  34.37 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  38.8 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  43.96 
 
 
348 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  37.92 
 
 
400 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 
351 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 
351 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 
351 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 
352 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  38.08 
 
 
343 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  43.29 
 
 
348 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 
352 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 
352 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 
352 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 
355 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.61 
 
 
355 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.61 
 
 
344 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1574  secretion protein HlyD  43.79 
 
 
348 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.26 
 
 
390 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  33.63 
 
 
351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  35.53 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  35.5 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.14 
 
 
387 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  35.26 
 
 
413 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.14 
 
 
387 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  33.51 
 
 
443 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  36.96 
 
 
351 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  35.14 
 
 
354 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  34.8 
 
 
358 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  33.05 
 
 
393 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 
395 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 
351 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  36.68 
 
 
351 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  32.42 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  33.84 
 
 
475 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 
475 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  33.88 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  34.15 
 
 
470 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 
404 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  36.01 
 
 
349 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  34.16 
 
 
400 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  33.24 
 
 
393 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  36.52 
 
 
355 aa  168  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1467  secretion protein HlyD  41.52 
 
 
342 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0027674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  34.77 
 
 
394 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6361  secretion protein HlyD family protein  41.52 
 
 
355 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  38.01 
 
 
390 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 
460 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 
460 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  34.63 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  34.84 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 
406 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 
468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7028  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146297  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  35.62 
 
 
363 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  34.39 
 
 
301 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  34.74 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  34.56 
 
 
394 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  35.41 
 
 
344 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  33.12 
 
 
331 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  31.82 
 
 
358 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  34.04 
 
 
354 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  32.49 
 
 
411 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  34.86 
 
 
383 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  32.65 
 
 
390 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.25 
 
 
383 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  32.65 
 
 
390 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  32.07 
 
 
394 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  34.93 
 
 
360 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  32.65 
 
 
390 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  35.5 
 
 
390 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  34 
 
 
400 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  35.13 
 
 
380 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  32.85 
 
 
390 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  35.53 
 
 
387 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  32.85 
 
 
390 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  32.85 
 
 
390 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>