More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0823 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
274 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  89.47 
 
 
249 aa  439  1e-122  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  89.47 
 
 
249 aa  437  1e-122  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  79.75 
 
 
249 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  78.75 
 
 
249 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  78.75 
 
 
254 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  79.17 
 
 
249 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  79.92 
 
 
251 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  79.76 
 
 
252 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  66.39 
 
 
253 aa  308  6e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  65.15 
 
 
253 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  64.73 
 
 
253 aa  301  8e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  64.73 
 
 
253 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  66.52 
 
 
249 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  66.52 
 
 
249 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  66.52 
 
 
249 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  63.49 
 
 
270 aa  280  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  60.87 
 
 
273 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  9.57079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  63.56 
 
 
272 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  62.95 
 
 
268 aa  272  5e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  59.76 
 
 
272 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  56.96 
 
 
244 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  63.09 
 
 
247 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  58.62 
 
 
248 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  57.83 
 
 
268 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  56.3 
 
 
247 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  57.5 
 
 
253 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  56.12 
 
 
247 aa  254  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  53.11 
 
 
248 aa  252  5e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  56.54 
 
 
273 aa  249  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  54.47 
 
 
262 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  58.37 
 
 
244 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  51.49 
 
 
255 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  50.2 
 
 
251 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  50.85 
 
 
251 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  50.86 
 
 
236 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  52.65 
 
 
237 aa  214  1e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  51.77 
 
 
237 aa  213  3e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  50.22 
 
 
232 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  52.1 
 
 
237 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  50.85 
 
 
233 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  50.64 
 
 
242 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  50.42 
 
 
233 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  50.64 
 
 
259 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  8.56086e-05  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  45.45 
 
 
260 aa  174  2e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  39.34 
 
 
246 aa  164  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  38.11 
 
 
248 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
230 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  39.22 
 
 
246 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  40.17 
 
 
236 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  40.71 
 
 
250 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  44.3 
 
 
234 aa  153  3e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
247 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  40 
 
 
249 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  39.32 
 
 
236 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
240 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
245 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
234 aa  140  2e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  40.89 
 
 
238 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
255 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  38.72 
 
 
299 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 
251 aa  134  2e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  40.52 
 
 
234 aa  133  2e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
234 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
274 aa  132  8e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  39.11 
 
 
242 aa  131  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  40.62 
 
 
242 aa  131  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
288 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  38.59 
 
 
240 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  36.91 
 
 
253 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  36.91 
 
 
238 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  42.06 
 
 
233 aa  120  2e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32950  transcriptional regulator, GntR family  53.33 
 
 
143 aa  120  2e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 
218 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 
218 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  34.07 
 
 
235 aa  119  4e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  37.78 
 
 
284 aa  119  4e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
249 aa  119  5e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 
218 aa  119  5e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
218 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  32.02 
 
 
238 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.04 
 
 
241 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  36.1 
 
 
218 aa  117  2e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
218 aa  117  2e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  35.84 
 
 
229 aa  117  2e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
218 aa  117  2e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  35.17 
 
 
245 aa  117  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.85286e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
218 aa  117  2e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 
218 aa  117  2e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  36.67 
 
 
252 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  34.96 
 
 
229 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  35.61 
 
 
215 aa  116  4e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
218 aa  116  4e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.56 
 
 
243 aa  116  4e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
252 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
246 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
246 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  36.89 
 
 
264 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
239 aa  112  8e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 
239 aa  112  8e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0593714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>