More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0791 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 454 aa  932    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 		 427 aa  90.5  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  27.97 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  27.23 
 
 		 456 aa  87.4  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.94 
 
 		 500 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.99 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.29 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  25.27 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  27.55 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.13 
 
 		 524 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  24.8 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.39 
 
 		 482 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.98 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 574 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.01 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.78 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  25.36 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.16 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 446 aa  67  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.67 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.69 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.81 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.41 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.51 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5748  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.37 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.44 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  30.41 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.14 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.48 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.93 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  25.25 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.8 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.61 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3967  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.301928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.35 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  22.72 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 1496 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3841  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.22 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626052  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.81 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.88 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.32 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.38 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.38 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.1 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.97 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  21.96 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1710  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  23.27 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.733437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.63 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.69 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.89 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  25.06 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.25 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.25 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.24 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.25 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.49 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.25 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.25 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.44 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  23.65 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.96 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.98 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1737  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  25.69 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>