170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24996 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24996  predicted protein  100 
 
 		 330 aa  677    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.073131  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76043  predicted protein  44.26 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.334358  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04317  Protein transport protein sec13 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B563]  44.14 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17465  predicted protein  44.59 
 
 		 294 aa  249  7e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03320  vesicle budding-related protein, putative  42.77 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443971  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60243  predicted protein  28.91 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.573964  normal  0.330306 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_4700  predicted protein  29.82 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.48 
 
 		 1652 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.48 
 
 		 1831 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1789 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.8 
 
 		 1686 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28.83 
 
 		 1656 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.54 
 
 		 1236 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.78 
 
 		 1547 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.52 
 
 		 1217 aa  72.8  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1714 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 1623 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1599 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.8 
 
 		 1598 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.69 
 
 		 1398 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.21 
 
 		 1193 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  31.4 
 
 		 1661 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.56 
 
 		 1357 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.09 
 
 		 1607 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00270  nuclear pore protein seh1, putative  32.12 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0000774214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.08 
 
 		 1609 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  27.36 
 
 		 1177 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.4 
 
 		 1363 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1552 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.48 
 
 		 696 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  28.39 
 
 		 1344 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.61 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.71 
 
 		 1583 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.56 
 
 		 1711 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 		 1481 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1553 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43665  predicted protein  27.84 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28 
 
 		 737 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1196 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.7 
 
 		 740 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.2 
 
 		 1161 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.52 
 
 		 1684 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.2 
 
 		 1161 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.41 
 
 		 630 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 		 947 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.67 
 
 		 1626 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  23.21 
 
 		 1348 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.38 
 
 		 1247 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  24.71 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.05 
 
 		 1557 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.68 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9020  predicted protein  26.49 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 1221 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.17 
 
 		 1213 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.24 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.74 
 
 		 1267 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1214 aa  59.3  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.08 
 
 		 1599 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1858 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.27 
 
 		 1209 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.16 
 
 		 1164 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.37 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1807 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.47 
 
 		 833 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.5 
 
 		 1617 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.5 
 
 		 1163 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 		 1016 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.23 
 
 		 677 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  25.66 
 
 		 540 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  34.85 
 
 		 1176 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.52 
 
 		 1901 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  24.21 
 
 		 657 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  26.42 
 
 		 1016 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 		 1264 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  24.92 
 
 		 1100 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 		 1264 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  22.55 
 
 		 589 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1510 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  26.17 
 
 		 1878 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.92 
 
 		 1364 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.55 
 
 		 1229 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.57 
 
 		 682 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  32.41 
 
 		 1279 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  23.38 
 
 		 1279 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05889  WD40 protein related to S. cerevisiae SEH1 (Eurofung)  23.85 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442783  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.77 
 
 		 664 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  28.86 
 
 		 426 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 		 1760 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.68 
 
 		 865 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  28.29 
 
 		 439 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.42 
 
 		 1262 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1190 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1491 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  24.36 
 
 		 1373 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60492  predicted protein  24.84 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.97 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  25.28 
 
 		 551 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  24.24 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.12 
 
 		 919 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.6 
 
 		 716 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>