284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12783 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12783  predicted protein  100 
 
 
363 aa  749    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31385  predicted protein  56.67 
 
 
462 aa  391  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000357166  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81799  substrate-specific activator of APC-dependent proteolysis  49.85 
 
 
592 aa  342  7e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0740559  normal  0.327492 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02965  cell cycle regulatory protein (Srw1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08280)  47.06 
 
 
592 aa  329  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.76845 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03780  conserved hypothetical protein  45.76 
 
 
695 aa  318  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_2648  predicted protein  48.36 
 
 
326 aa  305  6e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00814  cell division cycle protein Cdc20, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14730)  45.45 
 
 
618 aa  278  8e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60422  Anaphase promoting complex, Cdc20, Cdh1, and Ama1 subunits  40.29 
 
 
606 aa  268  1e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0258517  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04330  cell division control protein, putative  41.98 
 
 
525 aa  268  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_13512  predicted protein  52.31 
 
 
230 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0186669  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13210  predicted protein  52.31 
 
 
230 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00422519 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57298  predicted protein  29.5 
 
 
457 aa  149  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45416  predicted protein  27.74 
 
 
632 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.84 
 
 
696 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.47 
 
 
947 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.92 
 
 
1652 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.26 
 
 
1163 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.59 
 
 
1363 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.63 
 
 
1364 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.67 
 
 
930 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.18 
 
 
1523 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.35 
 
 
1831 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.16 
 
 
664 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.8 
 
 
1443 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.43 
 
 
1760 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.64 
 
 
698 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.26 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.6 
 
 
919 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.4 
 
 
1411 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.18 
 
 
576 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  26.92 
 
 
1041 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01982  cell cycle regulatory protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10570)  26.54 
 
 
818 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0011982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.23 
 
 
742 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.68 
 
 
1454 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.37 
 
 
1236 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.24 
 
 
676 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.62 
 
 
630 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.06 
 
 
1221 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
1196 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.87 
 
 
1190 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.2 
 
 
1004 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  24.93 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.65 
 
 
677 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.46 
 
 
1039 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
1686 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  22.99 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.68 
 
 
642 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.41 
 
 
1357 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.44 
 
 
1267 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.94 
 
 
1262 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.98 
 
 
1247 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.35 
 
 
924 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.24 
 
 
1193 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  29.94 
 
 
1858 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.67 
 
 
1868 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  22.92 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.92 
 
 
1399 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  25 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24 
 
 
1609 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 
1557 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.82 
 
 
1711 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.19 
 
 
740 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 
1348 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  29.24 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.86 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.62 
 
 
1416 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  24.51 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  23.24 
 
 
728 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.41 
 
 
682 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  25.95 
 
 
778 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.13 
 
 
1474 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  22.32 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  22.95 
 
 
589 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.76 
 
 
1072 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 
1211 aa  66.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  28.36 
 
 
774 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.78 
 
 
1188 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  25.4 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.22 
 
 
1789 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.42 
 
 
1072 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
596 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.32 
 
 
1598 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  24.41 
 
 
608 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  21.78 
 
 
1311 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  24.1 
 
 
578 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.56 
 
 
1344 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  26.54 
 
 
840 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.3 
 
 
1901 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  25.26 
 
 
551 aa  63.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.1 
 
 
1217 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.68 
 
 
1240 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.84 
 
 
1076 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19210  predicted protein  52.73 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.103438  hitchhiker  0.00628492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  29.35 
 
 
1209 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17898  predicted protein  52.73 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208361 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  21.95 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  24.02 
 
 
540 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.03 
 
 
733 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.11 
 
 
1878 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  25.22 
 
 
511 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>