More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4458 on replicon NC_011721
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
195 aa  404  1e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  65.97 
 
 
191 aa  273  2e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
196 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
197 aa  83.6  2e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 
194 aa  83.2  2e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  26.18 
 
 
195 aa  83.2  2e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 
193 aa  82.8  3e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  25.7 
 
 
186 aa  81.6  6e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  25.7 
 
 
186 aa  81.6  6e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  27.03 
 
 
179 aa  81.6  6e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 
193 aa  80.5  1e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
600 aa  80.1  2e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  27.53 
 
 
176 aa  79.3  3e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
187 aa  78.2  7e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
179 aa  76.3  2e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
191 aa  75.9  3e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
187 aa  75.9  3e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 
201 aa  75.1  7e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
187 aa  74.3  1e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
187 aa  74.3  1e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
187 aa  74.3  1e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
191 aa  73.6  2e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
188 aa  73.6  2e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
186 aa  72  5e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
198 aa  71.6  6e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  20.41 
 
 
198 aa  71.2  9e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
211 aa  70.5  1e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
188 aa  71.2  1e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
189 aa  70.5  1e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
188 aa  70.9  1e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
187 aa  70.9  1e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
188 aa  70.9  1e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
192 aa  70.9  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 
205 aa  70.1  2e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
188 aa  70.5  2e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
188 aa  70.5  2e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 
195 aa  69.7  2e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
188 aa  70.5  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
187 aa  69.3  3e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
188 aa  69.3  3e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
188 aa  68.6  6e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 
193 aa  68.2  7e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 
216 aa  68.2  7e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 
191 aa  68.2  7e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  25.41 
 
 
189 aa  68.2  8e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
188 aa  67.8  9e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 
167 aa  66.6  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 
195 aa  67  2e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
165 aa  65.9  4e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
193 aa  65.5  5e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 
181 aa  65.1  6e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
201 aa  65.1  7e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  25.19 
 
 
187 aa  65.1  7e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 
186 aa  63.9  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
188 aa  64.3  1e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
189 aa  63.2  2e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  22.47 
 
 
189 aa  62.8  3e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 
188 aa  61.6  7e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 
196 aa  60.8  1e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
196 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
197 aa  59.7  2e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  1.41576e-05 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
210 aa  59.3  3e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
245 aa  59.3  3e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
187 aa  58.5  5e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
207 aa  58.5  5e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
207 aa  58.5  5e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
207 aa  58.5  6e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
212 aa  57.8  1e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 
229 aa  57.8  1e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
213 aa  56.6  2e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
200 aa  56.6  2e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 
214 aa  56.6  2e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 
185 aa  56.2  3e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
214 aa  56.2  3e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
213 aa  55.8  4e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
184 aa  55.8  4e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.86865e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
215 aa  55.5  5e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 
226 aa  55.1  6e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
215 aa  55.5  6e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
211 aa  54.7  8e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
227 aa  54.7  8e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
236 aa  54.7  8e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  43.33 
 
 
211 aa  54.7  8e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 
221 aa  54.7  9e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
224 aa  54.7  9e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
197 aa  53.9  1e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
218 aa  53.9  1e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
217 aa  54.7  1e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
218 aa  54.3  1e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  23.88 
 
 
189 aa  54.3  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  29.47 
 
 
252 aa  53.9  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
196 aa  54.3  1e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  1.33916e-05 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 
237 aa  53.9  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
236 aa  53.5  2e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
211 aa  53.9  2e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>