More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0808 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
929 aa  1857    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 
989 aa  379  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 
989 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
939 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
870 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 
922 aa  366  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  43.2 
 
 
2051 aa  364  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.3 
 
 
865 aa  362  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 
811 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
1068 aa  355  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.06 
 
 
784 aa  347  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1090 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
937 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1090 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  46.78 
 
 
1257 aa  343  5.999999999999999e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.51 
 
 
721 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
770 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  40.47 
 
 
781 aa  337  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  38.87 
 
 
1322 aa  333  8e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
720 aa  331  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
1099 aa  330  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  39.4 
 
 
2109 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
1132 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
750 aa  325  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
773 aa  325  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
1323 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
935 aa  320  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  41.14 
 
 
1323 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
1070 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 
1285 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
1611 aa  311  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
1187 aa  310  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
1578 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  40.04 
 
 
810 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  40.18 
 
 
800 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
945 aa  305  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1075 aa  305  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
844 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
1350 aa  302  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
844 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  39.41 
 
 
1161 aa  298  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
1322 aa  298  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
765 aa  298  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  36.29 
 
 
1023 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
633 aa  291  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1203 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
882 aa  288  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
827 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
1146 aa  288  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 
785 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  36.31 
 
 
1193 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1127 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
791 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
1058 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
1202 aa  280  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  38.59 
 
 
1125 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
902 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 
1002 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 
1002 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 
803 aa  279  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 
1363 aa  278  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.62 
 
 
1120 aa  278  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 
995 aa  277  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
747 aa  277  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 
1128 aa  277  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
1130 aa  276  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.42 
 
 
1131 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  36.57 
 
 
882 aa  275  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  38.69 
 
 
1121 aa  275  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1350 aa  275  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.59 
 
 
737 aa  274  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
1070 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 
1120 aa  273  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
1002 aa  273  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1178 aa  272  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
1226 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
939 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
1070 aa  273  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
1193 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 
817 aa  271  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
969 aa  271  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  38.66 
 
 
1128 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
1193 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
738 aa  271  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  40.67 
 
 
1153 aa  271  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1255 aa  271  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1154 aa  270  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
1222 aa  270  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
1182 aa  270  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
969 aa  270  8.999999999999999e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.29 
 
 
620 aa  269  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
916 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
1029 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
1055 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  35.61 
 
 
982 aa  268  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
940 aa  268  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
1126 aa  267  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
657 aa  267  5.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
1596 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1287 aa  267  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>