More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0002 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
374 aa  740  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  3.74529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.41 
 
 
378 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  41.73 
 
 
380 aa  294  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  42.89 
 
 
376 aa  281  1e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.88302e-11  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.6 
 
 
381 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.86 
 
 
381 aa  263  5e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  37.34 
 
 
381 aa  262  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.41772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  37.34 
 
 
381 aa  262  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.27 
 
 
379 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  37.01 
 
 
379 aa  262  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.27 
 
 
379 aa  262  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.37 
 
 
378 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.67002e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  37.27 
 
 
379 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.27 
 
 
379 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.75 
 
 
379 aa  259  5e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  36.75 
 
 
379 aa  258  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  8.20509e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.37 
 
 
378 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 
377 aa  256  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 
377 aa  256  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  37.83 
 
 
377 aa  254  2e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.99 
 
 
380 aa  253  4e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  37.14 
 
 
378 aa  240  3e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.81 
 
 
378 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  36.51 
 
 
376 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  8.41235e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  36.24 
 
 
376 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0623e-09 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  36.24 
 
 
376 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  36.24 
 
 
376 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  35.45 
 
 
376 aa  223  5e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  34.66 
 
 
376 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  36.15 
 
 
376 aa  221  1e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  36.05 
 
 
376 aa  221  1e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  4.91978e-05 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  35.71 
 
 
376 aa  221  2e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.10658e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  34.73 
 
 
376 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.18 
 
 
366 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.18 
 
 
366 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.63 
 
 
367 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.56 
 
 
374 aa  190  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.53 
 
 
370 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.32 
 
 
365 aa  185  1e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.71 
 
 
370 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.29086e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 
366 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  5.53224e-06  hitchhiker  3.89013e-07 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  30.59 
 
 
366 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.89 
 
 
388 aa  174  3e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 
398 aa  173  4e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 
398 aa  173  4e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 
398 aa  173  4e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.47 
 
 
366 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.04 
 
 
369 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 
398 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 
398 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.67 
 
 
370 aa  167  3e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  29.18 
 
 
367 aa  159  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.47 
 
 
365 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 
369 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52181e-08 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.78 
 
 
366 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.73 
 
 
396 aa  154  3e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.88 
 
 
385 aa  153  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.76 
 
 
408 aa  153  6e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.86 
 
 
375 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  4.18991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  27.64 
 
 
402 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.12 
 
 
367 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.13 
 
 
365 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  5.99685e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 
367 aa  147  4e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  27.05 
 
 
394 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  24.42 
 
 
374 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.65 
 
 
385 aa  142  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl002  DNA polymerase III, beta chain  25.94 
 
 
373 aa  141  2e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.32 
 
 
380 aa  141  2e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  1.43991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.85 
 
 
387 aa  140  4e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  28.49 
 
 
366 aa  140  5e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  25.85 
 
 
372 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.87 
 
 
379 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25.73 
 
 
367 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.25 
 
 
396 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.9 
 
 
388 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.99 
 
 
366 aa  137  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  25.46 
 
 
382 aa  136  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  26.12 
 
 
374 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.96 
 
 
374 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.5514e-14 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.61 
 
 
378 aa  135  1e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.65 
 
 
372 aa  134  2e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.73 
 
 
365 aa  134  2e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.25 
 
 
389 aa  135  2e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 
374 aa  134  2e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.96 
 
 
374 aa  135  2e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 
376 aa  134  2e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0535  DNA polymerase III, beta subunit  24.2 
 
 
366 aa  134  2e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.06 
 
 
375 aa  134  2e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.140323  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.36 
 
 
390 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.94 
 
 
367 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  3.48538e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  27.55 
 
 
386 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.81 
 
 
386 aa  134  4e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  24.35 
 
 
372 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.46 
 
 
408 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.31 
 
 
370 aa  132  7e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  27.11 
 
 
373 aa  132  7e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  25.45 
 
 
377 aa  132  8e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.33 
 
 
366 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 
366 aa  131  2e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.13 
 
 
372 aa  129  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  2.75643e-08  normal  0.722211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>