141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4784 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1440 aa  919    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  54.19 
 
 		 1339 aa  1331    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  42.46 
 
 		 1346 aa  979    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  35.03 
 
 		 1441 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  100 
 
 		 1365 aa  2747    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  54.19 
 
 		 1339 aa  1331    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  37.19 
 
 		 1452 aa  756    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  37.91 
 
 		 1461 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  42.19 
 
 		 1347 aa  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  58.88 
 
 		 1347 aa  1543    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  52.59 
 
 		 1366 aa  1340    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  40.72 
 
 		 1363 aa  882    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1409 aa  800    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1321 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1342 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1353 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  34.8 
 
 		 1290 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1282 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  36.62 
 
 		 846 aa  412  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  44.05 
 
 		 536 aa  403  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1243 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  27.57 
 
 		 512 aa  159  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  27 
 
 		 1581 aa  152  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1151 aa  150  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.92 
 
 		 978 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1154 aa  136  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1188 aa  133  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  28.13 
 
 		 918 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1338 aa  129  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1170 aa  128  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  27.05 
 
 		 925 aa  124  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1184 aa  123  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1173 aa  122  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1018 aa  120  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  31.81 
 
 		 1322 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  26.69 
 
 		 869 aa  117  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  31.46 
 
 		 1331 aa  116  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  26.89 
 
 		 1432 aa  115  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  30.31 
 
 		 1306 aa  112  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  29.41 
 
 		 1338 aa  112  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  27.51 
 
 		 1186 aa  112  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  31.46 
 
 		 1358 aa  111  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  35.04 
 
 		 1343 aa  111  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  40.33 
 
 		 1422 aa  108  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  28.65 
 
 		 1712 aa  108  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1333 aa  103  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  44.16 
 
 		 1219 aa  102  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  38 
 
 		 1354 aa  101  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1612 aa  99  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.65 
 
 		 1277 aa  98.6  8e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  40.13 
 
 		 1319 aa  97.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  26.65 
 
 		 430 aa  96.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  35.5 
 
 		 1373 aa  96.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  36.84 
 
 		 1055 aa  95.5  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  36.67 
 
 		 1355 aa  94.7  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  41.45 
 
 		 1321 aa  94.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  39.49 
 
 		 1459 aa  94.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1426 aa  94.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1154 aa  94.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1339 aa  94  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  37.09 
 
 		 1336 aa  93.2  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.94 
 
 		 1278 aa  91.7  9e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  27.11 
 
 		 973 aa  91.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1022 aa  90.9  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1375 aa  90.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1104 aa  89.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1572 aa  86.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1575 aa  85.5  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  38.22 
 
 		 1318 aa  85.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.01 
 
 		 1573 aa  84.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1098 aa  84.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1349 aa  81.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1177 aa  81.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1184 aa  79.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1751 aa  78.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1546 aa  76.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1250 aa  75.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.14 
 
 		 995 aa  74.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1709 aa  73.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1250 aa  73.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1332 aa  72.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.25 
 
 		 1257 aa  71.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  19.69 
 
 		 1076 aa  70.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  32.18 
 
 		 926 aa  71.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  32.16 
 
 		 974 aa  71.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.51 
 
 		 1244 aa  70.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  37.58 
 
 		 1322 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  31.25 
 
 		 1041 aa  69.3  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  23.53 
 
 		 838 aa  68.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1088 aa  68.6  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1579 aa  68.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  29.38 
 
 		 1020 aa  68.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  22.72 
 
 		 1256 aa  68.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  23.99 
 
 		 1132 aa  67.4  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  23.25 
 
 		 1089 aa  67  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  28.4 
 
 		 333 aa  67.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  25.62 
 
 		 926 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1298 aa  66.6  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  23.91 
 
 		 1581 aa  66.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1338 aa  66.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>