More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1936 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.38 
 
 		 266 aa  251  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00538028  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2551  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.02 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1502  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.01 
 
 		 269 aa  244  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0097  serine protease  50.79 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2442  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.68 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000823282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.21 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.750805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1602  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.35 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4394  serine protease  46.85 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.76 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1208  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0754  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  28.76 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  30.29 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.21 
 
 		 381 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  30.16 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  31.96 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  31.96 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0016  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.02 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  28.15 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  30.77 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.92 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  32.99 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  28.09 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  30.61 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  29.67 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.43 
 
 		 483 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  32.12 
 
 		 402 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  32.12 
 
 		 402 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  30.29 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  29.41 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  30.1 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.02 
 
 		 484 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.02 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  28.38 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  30.93 
 
 		 503 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.23 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  28.93 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  28.2 
 
 		 462 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  30.41 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  30.41 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  30.41 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  30.39 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  30.41 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  30.41 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  30.41 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  30.41 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  32.02 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  30.41 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.32 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  31.44 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  29.44 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  28.32 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  26.73 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  29.69 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  28.93 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  28.93 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  28.93 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  29 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  27.05 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  32 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  30.15 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  29.63 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.22 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  27.23 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  32.04 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  28.43 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  30.05 
 
 		 583 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  27.76 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  29 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  29.26 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  29.63 
 
 		 505 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.82 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  29 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.5 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  30.39 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  31.68 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  35.37 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  27.92 
 
 		 482 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  29.17 
 
 		 511 aa  62.4  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  28.82 
 
 		 442 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  28.78 
 
 		 481 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  31.17 
 
 		 365 aa  62  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  27.32 
 
 		 467 aa  62  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  28.43 
 
 		 420 aa  62  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  29.76 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  26.99 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  29.63 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  28.93 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  29.19 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  30.24 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  31.37 
 
 		 501 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  29.44 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  28.93 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  30.5 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  29.15 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  31.25 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  29.15 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  29.13 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>