More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0799 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  74.58 
 
 
264 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  76.69 
 
 
262 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  72.2 
 
 
277 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  71.43 
 
 
455 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  70.21 
 
 
256 aa  348  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  70.82 
 
 
255 aa  347  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  70.66 
 
 
445 aa  343  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  69.83 
 
 
255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  66.67 
 
 
255 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  67.8 
 
 
253 aa  338  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  67.5 
 
 
291 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  64.08 
 
 
277 aa  324  9e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  66.38 
 
 
250 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  65.95 
 
 
247 aa  322  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  66.67 
 
 
253 aa  322  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  65.32 
 
 
261 aa  318  6e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  68.3 
 
 
268 aa  317  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  65.8 
 
 
258 aa  314  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  65.52 
 
 
256 aa  313  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  65.69 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  68.2 
 
 
257 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  63.44 
 
 
263 aa  308  6.999999999999999e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64.1 
 
 
280 aa  306  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  60.16 
 
 
271 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  63.48 
 
 
259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  67.93 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  64.98 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  65.37 
 
 
258 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.73 
 
 
274 aa  298  9e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  64.19 
 
 
244 aa  297  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64 
 
 
264 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  60.83 
 
 
258 aa  296  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
255 aa  295  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  61.57 
 
 
288 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  64.17 
 
 
257 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  61.76 
 
 
255 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  63.44 
 
 
252 aa  292  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  63.64 
 
 
302 aa  291  8e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  65.37 
 
 
258 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  62.22 
 
 
250 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
279 aa  275  5e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  58.82 
 
 
243 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  61.37 
 
 
293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
266 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  59.11 
 
 
256 aa  265  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  58.62 
 
 
252 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  54.51 
 
 
269 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  53.01 
 
 
271 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.67 
 
 
245 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  55.31 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  55.88 
 
 
249 aa  251  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  52.1 
 
 
279 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  54.08 
 
 
245 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.49 
 
 
249 aa  244  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  51.93 
 
 
243 aa  244  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  58.59 
 
 
272 aa  244  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  52.3 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  56.39 
 
 
255 aa  241  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  55.41 
 
 
277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  53.59 
 
 
241 aa  237  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  55.35 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.95 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  50.69 
 
 
225 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  52.19 
 
 
244 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  51.42 
 
 
225 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  53.68 
 
 
247 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.54 
 
 
228 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50.89 
 
 
240 aa  224  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.3 
 
 
239 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.36 
 
 
227 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  54.1 
 
 
249 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  56.16 
 
 
224 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.38 
 
 
269 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  48.18 
 
 
229 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
247 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
229 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.49 
 
 
240 aa  216  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  47.27 
 
 
229 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.35 
 
 
248 aa  215  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.5 
 
 
230 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  52.94 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  44.02 
 
 
227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 
253 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
246 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.08 
 
 
225 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.73 
 
 
226 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 
222 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.98 
 
 
227 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.49 
 
 
234 aa  209  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.49 
 
 
234 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  46 
 
 
253 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.58 
 
 
229 aa  209  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  46.26 
 
 
231 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.08 
 
 
234 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
255 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2588  ABC transporter related  45.04 
 
 
247 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0206492  hitchhiker  0.00398644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>