75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1673 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 487 aa  959    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  32.15 
 
 		 488 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 489 aa  96.7  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 491 aa  94.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 475 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 488 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  22.19 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  25.39 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  29.07 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 500 aa  57  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 475 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 504 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 488 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  19.69 
 
 		 499 aa  53.1  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 		 478 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  28.19 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 490 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 490 aa  50.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 501 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 		 522 aa  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 		 531 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.76 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  21 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  19.76 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 524 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 461 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  23.1 
 
 		 464 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 486 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  25.79 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  20.27 
 
 		 496 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.81 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1223  stage V sporulation protein B  24.71 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.30797  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  29.58 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1413  stage V sporulation protein B  25.1 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.208509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  20.51 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 519 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 509 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  25.86 
 
 		 519 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  30.72 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  24.56 
 
 		 523 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  27.27 
 
 		 525 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  28.15 
 
 		 519 aa  44.3  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 483 aa  43.9  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 470 aa  43.5  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.13 
 
 		 484 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>