More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4030 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  100 
 
 		 263 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  74.9 
 
 		 262 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  76.65 
 
 		 262 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  69.85 
 
 		 263 aa  384  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  63.46 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  63.08 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  63.08 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  63.08 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  63.08 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  63.08 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  63.08 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  63.08 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  69.58 
 
 		 262 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  64.06 
 
 		 275 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  72.47 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  62.69 
 
 		 275 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  62.89 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  64.34 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  63.95 
 
 		 277 aa  304  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  63.95 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  63.95 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  63.57 
 
 		 277 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  63.57 
 
 		 277 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  63.57 
 
 		 277 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  60.24 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  60.25 
 
 		 289 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  59.05 
 
 		 273 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  57.32 
 
 		 274 aa  258  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  58.85 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  53.63 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  43.08 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  43.63 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  47.83 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  46.67 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  44.49 
 
 		 262 aa  208  9e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  41.18 
 
 		 281 aa  201  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  41.34 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  45.27 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  41.96 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  41.15 
 
 		 271 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  41.27 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  42.35 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  38.58 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  38.58 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  44.68 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  44.68 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  41.87 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  41.31 
 
 		 282 aa  178  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  34.69 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  35.69 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  36.33 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  35.51 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  36.29 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  34.9 
 
 		 260 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  35.1 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  35.57 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  34.23 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  30.92 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  32.77 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.84 
 
 		 622 aa  101  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  26.42 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.03 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  30 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  29.55 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  28.43 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  23.95 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  23.95 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  28.77 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.12 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.16 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.29 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>