More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3274 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  327  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  37.11 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  28.85 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  33.54 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  28.21 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.85 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  0.00000022804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  24.84 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  27.04 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  27.56 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  27.04 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.19 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.19 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  27.75 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.67 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.3 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.63 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  30.82 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  26.62 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  23.46 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  30.43 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  28.93 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  29.11 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  31.21 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  29.27 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  39.02 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  24.05 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  29.85 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  30.53 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  28.21 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  29.87 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  26.8 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  27.92 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  28.85 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  27.63 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.93 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  25.81 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  38.89 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  30.26 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  30.26 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  27.85 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  26.25 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  28.21 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  25.32 
 
 		 296 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  28.66 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  28.83 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  26.62 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.41 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  27.5 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  40.26 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.41 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  27.56 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  26.11 
 
 		 370 aa  54.7  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.1 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  28.83 
 
 		 305 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  27.56 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  27.1 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  31.34 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  26.62 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.52 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.15 
 
 		 297 aa  54.3  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.86 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 289 aa  54.3  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  27.15 
 
 		 325 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  29.5 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  28.1 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  27.42 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  27.86 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  28.39 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  26.49 
 
 		 289 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.5 
 
 		 449 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  28.29 
 
 		 276 aa  52.4  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  34.21 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  30.89 
 
 		 301 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>