More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2282 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 685 aa  1397    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 920 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 		 1064 aa  354  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 893 aa  347  6e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 899 aa  344  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1260 aa  343  7e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 929 aa  334  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 		 1049 aa  333  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 916 aa  333  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.55 
 
 		 1442 aa  332  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1767 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1767 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1767 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1771 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 927 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1768 aa  327  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  37.64 
 
 		 1135 aa  326  9e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.37 
 
 		 1765 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 948 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.81 
 
 		 1763 aa  325  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 1782 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 1784 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 1792 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.76 
 
 		 2213 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 1310 aa  320  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 1786 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.68 
 
 		 923 aa  317  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.07 
 
 		 852 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.3 
 
 		 1014 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 1582 aa  313  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1240 aa  312  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 997 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 1550 aa  312  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  37.55 
 
 		 2035 aa  311  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 816 aa  311  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 		 1303 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 1574 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 1040 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1765 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 1266 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1245 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1309 aa  307  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 1689 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 1340 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  33.04 
 
 		 1287 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 		 1165 aa  303  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 985 aa  303  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 		 778 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 1234 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 1245 aa  302  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 2654 aa  301  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 1057 aa  300  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  34.69 
 
 		 1179 aa  300  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 1230 aa  300  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1398 aa  299  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  35.64 
 
 		 833 aa  299  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  35.75 
 
 		 1683 aa  298  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 1397 aa  298  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 990 aa  298  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1202 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 1305 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 		 993 aa  296  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.72 
 
 		 932 aa  296  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.41 
 
 		 1053 aa  296  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1236 aa  296  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1236 aa  296  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  35.81 
 
 		 1297 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 812 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1611 aa  296  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 1363 aa  296  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  37.48 
 
 		 1322 aa  296  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.97 
 
 		 927 aa  296  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  34.49 
 
 		 932 aa  296  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  36.25 
 
 		 1390 aa  295  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1236 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 1788 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 1234 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.46 
 
 		 948 aa  294  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  37.48 
 
 		 1188 aa  294  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 1326 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 		 946 aa  294  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 818 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 682 aa  294  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 833 aa  293  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  36.29 
 
 		 1200 aa  293  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1128 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 1245 aa  292  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  35.59 
 
 		 737 aa  292  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 1313 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 1238 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  34.04 
 
 		 765 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 		 977 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1548 aa  291  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1238 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1238 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1238 aa  291  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 981 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 1009 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 1166 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 1255 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>