188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_07210 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  100 
 
 
101 aa  196  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  78.02 
 
 
116 aa  144  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  78.02 
 
 
119 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  78.02 
 
 
109 aa  140  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  75.82 
 
 
120 aa  137  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  74.73 
 
 
114 aa  136  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  73.63 
 
 
99 aa  130  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  66.35 
 
 
104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  67.39 
 
 
101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  79.49 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  76 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  72.5 
 
 
179 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  61.39 
 
 
122 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  68.35 
 
 
89 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  59.09 
 
 
108 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  75.68 
 
 
119 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  68.35 
 
 
110 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  68.42 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  68.42 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  68.42 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  78.21 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  68.42 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  63.16 
 
 
112 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  75.68 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  76.92 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  68.6 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  57.27 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  65.06 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  72.22 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  51.82 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  68.12 
 
 
158 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  69.57 
 
 
135 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  63.64 
 
 
260 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 
250 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  58.02 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  65.22 
 
 
245 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  66.22 
 
 
228 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  66.22 
 
 
191 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  56.58 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  58.11 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  62.69 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  64.1 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  64.47 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  56.76 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  47.3 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  48.75 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 
118 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  47.22 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  42.68 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
192 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  37.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  37.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  37.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  37.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  37.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  37.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  37.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  37.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  37.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  49.32 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  36 
 
 
197 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 
188 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
225 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  47.83 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
286 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 
187 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 
198 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  35.82 
 
 
212 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  39.68 
 
 
204 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
205 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  39.34 
 
 
215 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
227 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 
255 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
189 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 
198 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
191 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
191 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.68 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 
201 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 
256 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
252 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
281 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.925102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>