More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0126 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 411 aa  825    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  75.62 
 
 		 416 aa  614  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  65.21 
 
 		 410 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  65.21 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  61.58 
 
 		 411 aa  502  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  63.79 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  62.75 
 
 		 414 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  61.82 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  58.82 
 
 		 402 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.36 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  56.78 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  58.4 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  55.47 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.77 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.85 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.13 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.38 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.31 
 
 		 430 aa  333  4e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.19 
 
 		 416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.26 
 
 		 419 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.61 
 
 		 431 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.32 
 
 		 429 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.11 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.56 
 
 		 414 aa  260  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.73 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.24 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.05 
 
 		 417 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.51 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.84 
 
 		 508 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.95 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.46 
 
 		 397 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  36.41 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.41 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.53 
 
 		 416 aa  186  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.77 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  35.62 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.61 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.61 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.14 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.7 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.94 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.03 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  33.24 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  32.03 
 
 		 420 aa  170  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.56 
 
 		 421 aa  169  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.77 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  32.03 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  32.13 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  35.42 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.79 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  35.93 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  31.65 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  30.95 
 
 		 412 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  33.17 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  35.14 
 
 		 398 aa  163  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  30.61 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  34.48 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  37.35 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  31.52 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  34.42 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  33.17 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  34.36 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  35.17 
 
 		 394 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0262  diaminopimelate decarboxylase  35.47 
 
 		 464 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  31.25 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  30.45 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  32.92 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  32.28 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  32.7 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  30.29 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  29.27 
 
 		 419 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  31.54 
 
 		 439 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  32.46 
 
 		 427 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  31.49 
 
 		 430 aa  155  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 		 422 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  33.59 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  29.55 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  32.99 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  34.39 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  32.91 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4702  diaminopimelate decarboxylase  32.12 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  32.69 
 
 		 430 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  32.07 
 
 		 386 aa  154  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  30.52 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  33.01 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0609  diaminopimelate decarboxylase  34.43 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.357283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  30.81 
 
 		 417 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  30.27 
 
 		 417 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  31.54 
 
 		 418 aa  152  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  30.56 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.75 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  31.85 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  30.62 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  32.92 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  30.03 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  30.92 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  31.82 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  33.16 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>