More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0780 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
287 aa  570  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  40.54 
 
 
294 aa  209  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 
291 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  37.46 
 
 
295 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  28.79 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  28.85 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 
241 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  38.51 
 
 
211 aa  87  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 
214 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 
231 aa  85.9  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  33.68 
 
 
213 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  38.04 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 
252 aa  82  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  32.62 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
237 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  26.85 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  38.51 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.2 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26.72 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.72 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  28.92 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
202 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  34.18 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
351 aa  65.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  32.7 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  31.94 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  31.94 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  31.94 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  31.94 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 
218 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  30.88 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  32.7 
 
 
217 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 
208 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  35.4 
 
 
217 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 
208 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  33.61 
 
 
201 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.67 
 
 
208 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  35.45 
 
 
207 aa  63.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 
321 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  34.78 
 
 
217 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.21 
 
 
207 aa  62.4  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 
321 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.33 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 
242 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  30.82 
 
 
191 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  28.42 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
209 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
207 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
202 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
217 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  32.02 
 
 
566 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.84 
 
 
213 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  34.06 
 
 
206 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 
215 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  32.08 
 
 
217 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 
252 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  36.96 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>