151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0234 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  100 
 
 		 476 aa  930    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  34.94 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  35.21 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  32.56 
 
 		 478 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  35.62 
 
 		 435 aa  189  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 		 440 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 526 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 444 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 541 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  29 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 542 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 486 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  24.12 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 482 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 472 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.54 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  23.56 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  23.98 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  22.37 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  20.96 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2260  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  31.31 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  24.36 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4839  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261545  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  23.7 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.3 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.77 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  20.73 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  23.08 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.77 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3696  polysaccharide synthase family protein  21.51 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  29.89 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  21.43 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 512 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2064  polysaccharide biosynthesis protein  20.86 
 
 		 468 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  25.13 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 		 1103 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  22.85 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  20.61 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 504 aa  53.5  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 427 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  23.61 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  24.62 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  29.26 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 484 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0386  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 1103 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>