132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0067 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  37.18 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  28.29 
 
 
255 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  28.51 
 
 
242 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  28.33 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  31.54 
 
 
252 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  34.68 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  36.32 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  35.11 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  35.43 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  33.63 
 
 
333 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  28.09 
 
 
272 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  32.24 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  31.94 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  30.77 
 
 
255 aa  82  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  34.73 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  34.85 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  37.62 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.78 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  35.42 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.02 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  34.62 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.95 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  31.62 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  30.6 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  35.34 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  34.68 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  31.2 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  30.6 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  34.02 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  31.94 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  35.22 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  26.67 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  29.9 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.14 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  34.63 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  30.87 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  31.43 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  34.3 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  27.8 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  29.24 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  28.08 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  27.2 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  30.13 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  30.18 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  29.88 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  30.84 
 
 
303 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  26.8 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  28.63 
 
 
275 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  27.6 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  26.91 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  31.43 
 
 
256 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.61 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  28.33 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  30.4 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.96 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  26.61 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.94 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  28.7 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1043  hypothetical protein  29.33 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  28.26 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  29.05 
 
 
314 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  32.22 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  27.2 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  26.02 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  31.58 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  25.74 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.83 
 
 
246 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  26.32 
 
 
263 aa  55.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  27.93 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  31.97 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  27.27 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  31.79 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  30.5 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  26.36 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  28.5 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  28.57 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  24.77 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  28.04 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  28.21 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  26.56 
 
 
233 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  24.8 
 
 
268 aa  52  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  28.02 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  28.02 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  28.02 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  56.36 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  27.8 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  31.65 
 
 
324 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  28.22 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  29.14 
 
 
303 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  32.77 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  26.78 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  26.25 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.15 
 
 
347 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  31.31 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  26.96 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  28.7 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  25.85 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  26.91 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>