105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0919 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1154    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  72.83 
 
 		 599 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  29.77 
 
 		 705 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  29.17 
 
 		 655 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  27.19 
 
 		 640 aa  171  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  27.74 
 
 		 649 aa  165  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  28.6 
 
 		 602 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  27.8 
 
 		 649 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  34.08 
 
 		 1013 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  26.96 
 
 		 677 aa  98.6  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  28.52 
 
 		 709 aa  94  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  26.92 
 
 		 604 aa  94  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  27.06 
 
 		 712 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  26.34 
 
 		 607 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  26.34 
 
 		 607 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  26.24 
 
 		 893 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  26.34 
 
 		 607 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  30.93 
 
 		 696 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  23.38 
 
 		 719 aa  81.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  27.87 
 
 		 732 aa  80.5  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  26.94 
 
 		 607 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.85 
 
 		 606 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.51 
 
 		 797 aa  76.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25.14 
 
 		 606 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  31.32 
 
 		 675 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  28.08 
 
 		 742 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  29.53 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  24.04 
 
 		 606 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  31.28 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  25.36 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  24.81 
 
 		 606 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  24.5 
 
 		 812 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  30.73 
 
 		 660 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  25.52 
 
 		 656 aa  72.8  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  24.13 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  26.67 
 
 		 794 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  25.57 
 
 		 608 aa  72  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  20.79 
 
 		 703 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  29.77 
 
 		 826 aa  70.5  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  30.25 
 
 		 654 aa  68.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  25.11 
 
 		 508 aa  66.6  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1080 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  20.9 
 
 		 695 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  24.7 
 
 		 611 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  26.52 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  22.92 
 
 		 612 aa  64.7  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  20.27 
 
 		 695 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  25.24 
 
 		 682 aa  62.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  26.14 
 
 		 646 aa  62  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  24 
 
 		 640 aa  60.1  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  25.47 
 
 		 762 aa  58.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  20.73 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  29.86 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  27.33 
 
 		 655 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  27.04 
 
 		 735 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  25.83 
 
 		 791 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  23.91 
 
 		 649 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  26.27 
 
 		 789 aa  56.2  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1217 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  29.05 
 
 		 669 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.7 
 
 		 656 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  27.57 
 
 		 654 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  21.47 
 
 		 614 aa  54.7  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  26.72 
 
 		 701 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  21.8 
 
 		 618 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  21.8 
 
 		 618 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  23.67 
 
 		 711 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  25.38 
 
 		 643 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  22.88 
 
 		 645 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  21.8 
 
 		 618 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  21.8 
 
 		 618 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  21.8 
 
 		 618 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  29.57 
 
 		 632 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1284 aa  51.6  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  20.54 
 
 		 617 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  19.47 
 
 		 611 aa  50.8  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  22.32 
 
 		 741 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  25.91 
 
 		 745 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  29.18 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  20.08 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  30.67 
 
 		 648 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  20.47 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  24.92 
 
 		 1094 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  20.08 
 
 		 617 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  23.2 
 
 		 1079 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  24.4 
 
 		 1191 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  20.08 
 
 		 617 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  20.08 
 
 		 617 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  20.08 
 
 		 617 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  24.41 
 
 		 747 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  19.69 
 
 		 617 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  28.83 
 
 		 634 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  29.46 
 
 		 642 aa  47.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  19.69 
 
 		 617 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  26.05 
 
 		 748 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1095 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  24.78 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  27.19 
 
 		 580 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  24.44 
 
 		 1061 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  24.31 
 
 		 1070 aa  45.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>