168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3536 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  67.84 
 
 		 489 aa  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 513 aa  1028    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  65.37 
 
 		 488 aa  634  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  67.69 
 
 		 486 aa  622  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  56.81 
 
 		 488 aa  537  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  53.97 
 
 		 495 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  55.49 
 
 		 504 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  55.4 
 
 		 505 aa  511  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  53.92 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  51.79 
 
 		 503 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50.31 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  50.42 
 
 		 490 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  49.58 
 
 		 478 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 490 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  49.17 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  47.89 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  27.57 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  25.81 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  24.48 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  28.02 
 
 		 475 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  25.53 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  27.78 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 480 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  26.78 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  24.95 
 
 		 470 aa  62  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  25.89 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  25.86 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  25.7 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  23.02 
 
 		 500 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  23.96 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  22.65 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 481 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  27.2 
 
 		 467 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 203 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 202 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 476 aa  53.9  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  25.41 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 192 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  22.9 
 
 		 466 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 469 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  25.84 
 
 		 481 aa  50.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 482 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  37.36 
 
 		 414 aa  50.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  24.95 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 483 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  37.31 
 
 		 208 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  24.74 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 193 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 198 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  23.98 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  27.23 
 
 		 477 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  24.03 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  24.1 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  25.4 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 477 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3859  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 67 aa  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 117 aa  47.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  24.36 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 143 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  22.58 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  22.9 
 
 		 477 aa  47.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 461 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  27.62 
 
 		 461 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 512 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 105 aa  47  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  24.3 
 
 		 466 aa  47  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  22.25 
 
 		 490 aa  47  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 488 aa  47  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 201 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 470 aa  47  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 67 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 67 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 204 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0337  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 83 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160189  normal  0.0633386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  26.3 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 		 191 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 470 aa  47  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  39.19 
 
 		 215 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>