56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3464 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  75.98 
 
 		 442 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  74.94 
 
 		 450 aa  639    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  100 
 
 		 445 aa  886    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  61.73 
 
 		 424 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  60.3 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  60.64 
 
 		 440 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  59.2 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  49.76 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  47.85 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  51.21 
 
 		 587 aa  364  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  44.57 
 
 		 446 aa  361  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  42.03 
 
 		 453 aa  343  4e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  42.17 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  28.92 
 
 		 583 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.85 
 
 		 737 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  30.22 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  28.67 
 
 		 589 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  30.96 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  32.28 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  27.06 
 
 		 532 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  27.77 
 
 		 533 aa  136  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  26.7 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  28.25 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  30.93 
 
 		 612 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  27.48 
 
 		 471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  29.73 
 
 		 693 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  27.75 
 
 		 658 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  29.1 
 
 		 567 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  27.65 
 
 		 548 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  25.78 
 
 		 535 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  23.77 
 
 		 604 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  24.39 
 
 		 677 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  27.7 
 
 		 597 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  25.76 
 
 		 727 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  25.93 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  29.39 
 
 		 541 aa  106  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  25.68 
 
 		 547 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  24.52 
 
 		 568 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  27.14 
 
 		 413 aa  96.3  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  26.16 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  26.38 
 
 		 574 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  22.62 
 
 		 411 aa  90.1  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  24.89 
 
 		 403 aa  89.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  24.29 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  24.19 
 
 		 631 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  25.23 
 
 		 640 aa  73.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  24.08 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  23.6 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  23.35 
 
 		 850 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  22.74 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  20 
 
 		 1172 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  22.76 
 
 		 469 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  24.36 
 
 		 320 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  30 
 
 		 674 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  27.31 
 
 		 782 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  30.56 
 
 		 675 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>