More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1653 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  71.21 
 
 		 1058 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  74.53 
 
 		 1117 aa  850    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  70.13 
 
 		 959 aa  665    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  74.84 
 
 		 1048 aa  703    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  76.13 
 
 		 908 aa  719    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  64.91 
 
 		 1024 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  75.65 
 
 		 922 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  71.31 
 
 		 1091 aa  688    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  75.43 
 
 		 1194 aa  724    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  64.49 
 
 		 1016 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  75.87 
 
 		 990 aa  714    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  66.73 
 
 		 1041 aa  708    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  78.19 
 
 		 1265 aa  867    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  68.76 
 
 		 717 aa  649    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  71.18 
 
 		 1093 aa  701    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  61.2 
 
 		 991 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  61.2 
 
 		 987 aa  641    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  79.87 
 
 		 944 aa  802    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  74.03 
 
 		 1151 aa  729    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 1018 aa  2025    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  67.63 
 
 		 1080 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  74.19 
 
 		 1113 aa  727    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  64.56 
 
 		 974 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  52.32 
 
 		 1123 aa  659    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  77.17 
 
 		 1244 aa  689    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  66.6 
 
 		 1040 aa  692    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  74.35 
 
 		 1427 aa  721    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  73.59 
 
 		 702 aa  689    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  72.73 
 
 		 1070 aa  685    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  74.02 
 
 		 1334 aa  749    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  61.2 
 
 		 991 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  61.8 
 
 		 961 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  75.6 
 
 		 1007 aa  718    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  65.17 
 
 		 1022 aa  632  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  63.9 
 
 		 1093 aa  631  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  66.46 
 
 		 953 aa  620  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  45.53 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  45.55 
 
 		 636 aa  323  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  44.23 
 
 		 559 aa  321  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  40.94 
 
 		 492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  41.01 
 
 		 494 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  41.15 
 
 		 562 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  39.34 
 
 		 503 aa  303  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  42.31 
 
 		 564 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  41.75 
 
 		 497 aa  303  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  41.75 
 
 		 497 aa  301  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.75 
 
 		 531 aa  299  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  42.93 
 
 		 411 aa  298  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  42.08 
 
 		 489 aa  298  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  44.42 
 
 		 571 aa  297  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  41.04 
 
 		 483 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  38.14 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  38.14 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  42 
 
 		 496 aa  295  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  42.24 
 
 		 496 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  40.79 
 
 		 496 aa  295  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.76 
 
 		 543 aa  295  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  41.75 
 
 		 489 aa  291  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  41.13 
 
 		 491 aa  291  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  41.34 
 
 		 489 aa  291  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  41.34 
 
 		 489 aa  291  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  41.19 
 
 		 492 aa  290  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  40 
 
 		 503 aa  290  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  41.1 
 
 		 490 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  40.05 
 
 		 499 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1593  ribonuclease  39.57 
 
 		 1128 aa  288  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  43.75 
 
 		 485 aa  288  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  43.75 
 
 		 485 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  39.6 
 
 		 485 aa  286  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  38.61 
 
 		 1076 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  41.59 
 
 		 497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  41.25 
 
 		 489 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  38.87 
 
 		 1102 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1490  ribonuclease, Rne/Rng family protein  39.68 
 
 		 1124 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.326409  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  39.57 
 
 		 1084 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  43.25 
 
 		 492 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  38.77 
 
 		 1142 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  43.36 
 
 		 485 aa  283  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  40.5 
 
 		 489 aa  283  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  40.75 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  40.75 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  40.75 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  41.5 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  40.75 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  40.75 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  40.75 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  40.75 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  40.75 
 
 		 489 aa  283  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  39.78 
 
 		 1175 aa  282  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0479  ribonuclease  39.57 
 
 		 1368 aa  281  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  40.75 
 
 		 489 aa  281  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  40.1 
 
 		 495 aa  281  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  38.16 
 
 		 501 aa  281  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  38.54 
 
 		 483 aa  280  7e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2475  RNAse E  38.87 
 
 		 1095 aa  280  9e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.350754  normal  0.0309861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  37.38 
 
 		 1074 aa  280  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  38.46 
 
 		 1007 aa  280  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2634  ribonuclease  38.24 
 
 		 1201 aa  280  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0740113  hitchhiker  0.00367459 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  41.67 
 
 		 483 aa  279  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  43.52 
 
 		 1031 aa  279  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>