More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0575 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  100 
 
 
270 aa  528  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.25 
 
 
287 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  42.86 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  42.86 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  42.55 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  31.43 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  47.83 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  41.05 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  43.9 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  40.96 
 
 
226 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  40.96 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  40.51 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  40.91 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  39.76 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  39.76 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  39.76 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  47.56 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  40.91 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  47.56 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  44.44 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  45.57 
 
 
215 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  44.44 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  44.44 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  43.33 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  45.98 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  43.9 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  39.77 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  40 
 
 
441 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  39.76 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  39.76 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  45.35 
 
 
273 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  45.35 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.89 
 
 
233 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  45.35 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  35.96 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  42.55 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  30.22 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  30.22 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  43.59 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  33.85 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  36.56 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  40.48 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  42.05 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  43.21 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  43.21 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  43.42 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  38.75 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  39.24 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  43.21 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  42.68 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  43.21 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  38.96 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  34.76 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  31.28 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  39.18 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  40.74 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  38.27 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  40.74 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  42.86 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  39.51 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  38.96 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  33.33 
 
 
230 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  37.66 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  40.74 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  37.66 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  37.66 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  37.66 
 
 
246 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  37.66 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  37.66 
 
 
246 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  33.68 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  37.66 
 
 
246 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  36.36 
 
 
184 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  45.57 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  38.96 
 
 
217 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  38.14 
 
 
140 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  36.26 
 
 
221 aa  62.4  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  30.86 
 
 
269 aa  62  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  36.26 
 
 
221 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  35.42 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  38.96 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30.49 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  39.02 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  37.66 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.5 
 
 
459 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  27.97 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  37.18 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  28.16 
 
 
582 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  37.97 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  37.5 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  33.6 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  42.86 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  37.17 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  36.46 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  42.86 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  36.71 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  40.62 
 
 
368 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  41.49 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  42.86 
 
 
349 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.71 
 
 
112 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  42.11 
 
 
290 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>