75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3069 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  100 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  41.73 
 
 		 254 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  40.97 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  42.03 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  37.14 
 
 		 242 aa  77.4  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  41.06 
 
 		 241 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  33.77 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  36.99 
 
 		 241 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  35.62 
 
 		 261 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  34.29 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  46.15 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  37.32 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  35.25 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  33.58 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  41.3 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  45 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  33.08 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  34.01 
 
 		 590 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  37.14 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  38.61 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  34.69 
 
 		 340 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  37.16 
 
 		 316 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  34.41 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  32.85 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  42.67 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  35.71 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  36.5 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  46.25 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  27.86 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  33.11 
 
 		 327 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  31.25 
 
 		 272 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  36.46 
 
 		 262 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  31.39 
 
 		 280 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  36.46 
 
 		 262 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  43.75 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  36.46 
 
 		 262 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  31.03 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  35.37 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  31.43 
 
 		 264 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  28.48 
 
 		 323 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  35.71 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  36.84 
 
 		 293 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 268 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  28.37 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  31.88 
 
 		 635 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  34.23 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  26.71 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  29.08 
 
 		 247 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  29.56 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  33.71 
 
 		 343 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2553  RDD domain-containing protein  30.34 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594635  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  30.68 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2516  RDD domain-containing protein  30.34 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2561  RDD domain-containing protein  30.34 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.636636  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  27.34 
 
 		 264 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  29.09 
 
 		 272 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  35.11 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  29.08 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  32.41 
 
 		 174 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  26.39 
 
 		 137 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  28.28 
 
 		 145 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  32.43 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  32.88 
 
 		 285 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  30.67 
 
 		 241 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  30.3 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  31.25 
 
 		 211 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  32 
 
 		 269 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 257 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  33.01 
 
 		 159 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  33.01 
 
 		 159 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  33.01 
 
 		 159 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>