18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2516 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2516  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2561  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.636636  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2553  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594635  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  34.72 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  28.74 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  33.56 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  27.55 
 
 		 270 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  30.34 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  31.01 
 
 		 135 aa  44.3  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  39.81 
 
 		 514 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  33.72 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  34.75 
 
 		 241 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  29.68 
 
 		 274 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  30.85 
 
 		 498 aa  41.6  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1103  hypothetical protein  34.83 
 
 		 284 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  28.37 
 
 		 258 aa  41.2  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  27.41 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  28.97 
 
 		 393 aa  40.8  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>