More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2582 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  61.39 
 
 		 252 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  40.99 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  36.6 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  36.6 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  36.6 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  45 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  37.19 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  39.87 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  38.95 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  38.51 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  38.51 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  38.12 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  31.37 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  34.22 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  35.54 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  35.76 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  36.59 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  31.84 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  34.57 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  32.93 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  33.74 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  35.66 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.9 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  36.05 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  34.57 
 
 		 936 aa  88.2  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  42.74 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2859  polysaccharide export protein  35.67 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2951  polysaccharide export protein  35.67 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.43 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  26.44 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  35.58 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 277 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  33.95 
 
 		 781 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 948 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  35.62 
 
 		 270 aa  85.9  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  25.25 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  37.8 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  30.59 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  37.11 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 1055 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  32.6 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.87 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  30 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  34.65 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  40.5 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  30.35 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  34.92 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  31.44 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  33.95 
 
 		 952 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  41.46 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  35.66 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  34.68 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  34.52 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  30.51 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 828 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 919 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  33.79 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.5 
 
 		 910 aa  79  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  26.88 
 
 		 869 aa  79  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  37.38 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  37.4 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  37.8 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  41.12 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 379 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  34.96 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  37.4 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 351 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 828 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 348 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 348 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  31.98 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  32.31 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 803 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  28.23 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  35.77 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  32.42 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.98 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  30.32 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.46 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  32.46 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>