296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4235 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  100 
 
 
205 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  36.92 
 
 
191 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  34.18 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  34.52 
 
 
185 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  34.01 
 
 
185 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  35.36 
 
 
252 aa  91.7  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  32.97 
 
 
184 aa  88.2  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  31.71 
 
 
185 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  33.7 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30.51 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  31.01 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  31.25 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  31.94 
 
 
495 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.42 
 
 
495 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.91 
 
 
495 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  28.49 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  29.95 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  27.68 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  29.38 
 
 
948 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  29.05 
 
 
869 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  25.66 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  29.73 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  28.65 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  29.35 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  30.1 
 
 
492 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.08 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  30.9 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.93 
 
 
388 aa  65.1  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  30.81 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  29.95 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  27.92 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  31.52 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.48 
 
 
446 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  36.13 
 
 
391 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  30.48 
 
 
387 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25 
 
 
852 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  28.5 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  27.01 
 
 
580 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  29.95 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.48 
 
 
400 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  29.35 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
221 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  26.34 
 
 
919 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  30 
 
 
422 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.8 
 
 
379 aa  62.8  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.8 
 
 
379 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  26.67 
 
 
362 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  29.38 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  25.7 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.8 
 
 
379 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  26.03 
 
 
177 aa  62  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.8 
 
 
348 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.8 
 
 
351 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  29.5 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.8 
 
 
348 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  27.08 
 
 
365 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  29.38 
 
 
192 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  29.38 
 
 
192 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.22 
 
 
396 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  30.39 
 
 
253 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  28.21 
 
 
379 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  28.21 
 
 
379 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.21 
 
 
379 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  27.57 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  28.21 
 
 
379 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  24.06 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  28.99 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.21 
 
 
379 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  28.21 
 
 
379 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.21 
 
 
379 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.02 
 
 
431 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  23.62 
 
 
277 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  34.19 
 
 
391 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  22.04 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.21 
 
 
379 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  25.65 
 
 
268 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.1 
 
 
379 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  29.95 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  26.42 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  31.55 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  25.67 
 
 
187 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  26.26 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  30.32 
 
 
392 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.37 
 
 
379 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  33.12 
 
 
384 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.38 
 
 
391 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.38 
 
 
391 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.38 
 
 
396 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.38 
 
 
396 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.26 
 
 
387 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  30.32 
 
 
392 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  33.77 
 
 
384 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  33.55 
 
 
385 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28.02 
 
 
212 aa  58.2  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  28.26 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  36.27 
 
 
992 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  27.18 
 
 
992 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  26.41 
 
 
393 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  24.72 
 
 
473 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>