288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0468 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  100 
 
 		 387 aa  766    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  68.31 
 
 		 357 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  34.29 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  34.42 
 
 		 358 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  36.48 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 495 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 478 aa  123  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 495 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  31.31 
 
 		 551 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  29.58 
 
 		 508 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 492 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  24.58 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  27.97 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08781  hypothetical protein  25.07 
 
 		 415 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165811 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  25.54 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 580 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.45 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  23.66 
 
 		 577 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.55 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  25.66 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  25.6 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  28.57 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  24.76 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  31.18 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  22.85 
 
 		 830 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  24.75 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  26.23 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  29 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  27.43 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  25 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  25.1 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 241 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  24.19 
 
 		 846 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  26.74 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  24 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.5 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  23.14 
 
 		 869 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  23.4 
 
 		 781 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.18 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  21.53 
 
 		 919 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  22.22 
 
 		 910 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  26.48 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  26.52 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  21.67 
 
 		 922 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  24.69 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  23.55 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  23.02 
 
 		 948 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  30.48 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  23.33 
 
 		 912 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  25 
 
 		 803 aa  63.2  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  25 
 
 		 827 aa  62.8  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  26.45 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  30.07 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  24.51 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.03 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  22.46 
 
 		 869 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  24.93 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  23.59 
 
 		 830 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  33.83 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  26.55 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  23.75 
 
 		 931 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  27.74 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  22.83 
 
 		 915 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  26.55 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  24 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  25.26 
 
 		 897 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  29.41 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  26.52 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  22.96 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  28 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  25.09 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  23.83 
 
 		 919 aa  60.1  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  22.26 
 
 		 828 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  27.31 
 
 		 700 aa  59.7  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.4 
 
 		 920 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 921 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  23.48 
 
 		 828 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.31 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  24.7 
 
 		 823 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.31 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  24.61 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  24.61 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  25.35 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  24.61 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.31 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.31 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  29.3 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>