More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1650 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  403  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 199 aa  208  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  206  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  52.11 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  26.73 
 
 		 241 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.59 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.16 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  30.54 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  24.31 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  29.75 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 249 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  25.59 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
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NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  25.51 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_4037  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.766436 
 
 
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NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
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