179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2612 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  37.21 
 
 		 1061 aa  708    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  37.34 
 
 		 1080 aa  715    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  37.36 
 
 		 1079 aa  708    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  43.18 
 
 		 1070 aa  859    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  100 
 
 		 1094 aa  2203    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  38.88 
 
 		 1104 aa  800    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  37.39 
 
 		 1061 aa  716    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1102 aa  227  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  26.6 
 
 		 1234 aa  94.7  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  30.7 
 
 		 1144 aa  87.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  26.23 
 
 		 1224 aa  75.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  26.48 
 
 		 1384 aa  69.7  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1341 aa  66.6  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1397 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1397 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1397 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1426 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1368 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  27.09 
 
 		 1426 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1397 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1372 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1397 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1397 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1210 aa  63.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  29.24 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1426 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1399 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1398 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1398 aa  61.6  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1419 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.84 
 
 		 632 aa  60.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  25.93 
 
 		 812 aa  60.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1264 aa  60.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  26.14 
 
 		 649 aa  61.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1398 aa  61.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  26.07 
 
 		 1379 aa  60.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  21.88 
 
 		 618 aa  60.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1210 aa  59.7  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  27.37 
 
 		 893 aa  59.3  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  23.77 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1394 aa  59.7  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  22.37 
 
 		 618 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  21.56 
 
 		 618 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  25.79 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  22.37 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1399 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1399 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1399 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1284 aa  57.4  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1420 aa  58.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  25.93 
 
 		 688 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  21.56 
 
 		 618 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1197 aa  56.2  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1399 aa  56.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  23.6 
 
 		 794 aa  56.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  29.26 
 
 		 688 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1384 aa  55.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  29.26 
 
 		 688 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  29.26 
 
 		 688 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.92 
 
 		 640 aa  55.1  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  25.21 
 
 		 735 aa  55.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  22.61 
 
 		 921 aa  54.7  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  24.04 
 
 		 669 aa  54.7  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  22.81 
 
 		 611 aa  54.3  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  22.43 
 
 		 618 aa  54.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  22.57 
 
 		 711 aa  54.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1255 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  22.43 
 
 		 618 aa  54.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  22.43 
 
 		 618 aa  54.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1273 aa  53.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1273 aa  53.5  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  27.15 
 
 		 797 aa  53.5  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1441 aa  53.5  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1430 aa  53.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  26.17 
 
 		 712 aa  53.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1307 aa  52.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1240 aa  53.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  22.94 
 
 		 649 aa  52.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1162 aa  52.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  30.09 
 
 		 826 aa  52.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1419 aa  52.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1237 aa  52.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1243 aa  52  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1290 aa  51.6  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  20.65 
 
 		 1070 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1379 aa  51.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  24.03 
 
 		 677 aa  50.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  24.55 
 
 		 830 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  24.55 
 
 		 830 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1088 aa  50.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1091  hypothetical protein  21.97 
 
 		 853 aa  50.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  23.96 
 
 		 689 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  24.55 
 
 		 830 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  24.55 
 
 		 830 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  24.55 
 
 		 830 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  24.55 
 
 		 824 aa  50.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  24.55 
 
 		 830 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  24.33 
 
 		 680 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  23.21 
 
 		 765 aa  49.7  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  24.92 
 
 		 611 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>