113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3324 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  100 
 
 		 416 aa  836    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  66.1 
 
 		 859 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  66.1 
 
 		 859 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  66.1 
 
 		 859 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  66.25 
 
 		 856 aa  549  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  65.84 
 
 		 863 aa  545  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  65.75 
 
 		 859 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  65.5 
 
 		 859 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  65.04 
 
 		 860 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  64.86 
 
 		 836 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  66.67 
 
 		 867 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  65.15 
 
 		 881 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  63.05 
 
 		 857 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  62.41 
 
 		 871 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  63.59 
 
 		 875 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  63.7 
 
 		 841 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  61.5 
 
 		 842 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  63.38 
 
 		 859 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  60.05 
 
 		 872 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  62.53 
 
 		 852 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  62.47 
 
 		 884 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  65.59 
 
 		 838 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  59.9 
 
 		 811 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  63.29 
 
 		 944 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  63.75 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  61.77 
 
 		 899 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  60.12 
 
 		 779 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  53.23 
 
 		 800 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  50.93 
 
 		 792 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  51.47 
 
 		 826 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  44.71 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  51.49 
 
 		 820 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  48.47 
 
 		 380 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  47.41 
 
 		 386 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  44.94 
 
 		 841 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  42.72 
 
 		 390 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  49.26 
 
 		 757 aa  280  3e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46.65 
 
 		 419 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  45.86 
 
 		 565 aa  276  7e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  38.72 
 
 		 352 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  38.95 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  37.91 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  41.46 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  38.39 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  40.83 
 
 		 325 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  40.83 
 
 		 329 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  43.89 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.08 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.07 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  41.54 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  40.18 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  45.29 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  44.89 
 
 		 372 aa  236  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  40 
 
 		 326 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.9 
 
 		 741 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.8 
 
 		 737 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  32.84 
 
 		 319 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  36.28 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  34.23 
 
 		 318 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  33.93 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.37 
 
 		 737 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  35 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  34.07 
 
 		 307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  33.43 
 
 		 340 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  35.13 
 
 		 325 aa  126  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  26.41 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  25.71 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  25.71 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 515 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  23.69 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  22.74 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  24.25 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 		 385 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  23.35 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  24.14 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  22 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  24.25 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 625 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  24.11 
 
 		 453 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 368 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  24.4 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  25.31 
 
 		 362 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.76 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  23.55 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 626 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 626 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  24.89 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  24.35 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>