More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1262 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 149 aa  296  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  97.99 
 
 		 149 aa  290  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  64.86 
 
 		 149 aa  218  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  63.09 
 
 		 149 aa  209  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  55.41 
 
 		 149 aa  183  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  65.77 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  53.02 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  51.7 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  46.94 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  42.57 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  40.94 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  45.83 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  38.93 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  39.86 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  40.28 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  40.28 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  39.31 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 		 150 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  38.78 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  36.05 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  39.04 
 
 		 247 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  33.56 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  34.97 
 
 		 152 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  34.27 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  31.76 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  36.42 
 
 		 241 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  34.93 
 
 		 246 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  37.41 
 
 		 230 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  35.66 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  36.73 
 
 		 230 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  35.33 
 
 		 153 aa  97.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.33 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  34.23 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  34.23 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  38.19 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 		 246 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 230 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  35.1 
 
 		 339 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.22 
 
 		 338 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  33.79 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.64 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  35.29 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 		 242 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  33.97 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 		 228 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  34.42 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  34.67 
 
 		 339 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.93 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  31.29 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  34 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.94 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  34.62 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  33.97 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.51 
 
 		 249 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  33.78 
 
 		 229 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  31.76 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 333 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  35.66 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  34 
 
 		 348 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  35.06 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  28.57 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  30.82 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  28.77 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  32.43 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  30.41 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  29.41 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  32.24 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  27.4 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  27.78 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  35.92 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.21 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.77 
 
 		 242 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  27.78 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  31.41 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  29.73 
 
 		 236 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  32.17 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 394 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  35.92 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.87 
 
 		 628 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  24.66 
 
 		 243 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  31.65 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  28.08 
 
 		 201 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  25.69 
 
 		 217 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  31.29 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.34 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  28.28 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  25.85 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>