136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0057 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0060  stage II sporulation protein E  58.32 
 
 
792 aa  930    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00425059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0061  stage II sporulation protein E  57.93 
 
 
808 aa  935    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  57.93 
 
 
808 aa  935    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  58.45 
 
 
792 aa  931    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0061  stage II sporulation protein E  58.32 
 
 
792 aa  930    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000183348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
826 aa  1696    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0057  sporulation stage II protein E  58.54 
 
 
815 aa  945    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  57.32 
 
 
823 aa  953    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0073  stage II sporulation protein E  56.71 
 
 
823 aa  936    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00108149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0069  stage II sporulation protein E  56.95 
 
 
823 aa  944    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00552781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5247  stage II sporulation protein E  56.95 
 
 
823 aa  944    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0104377  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0070  stage II sporulation protein E  56.71 
 
 
823 aa  936    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0059  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  79.81 
 
 
826 aa  1290    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0195  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  30.38 
 
 
821 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2681  serine phosphatase  28.72 
 
 
798 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0790  phosphoprotein phosphatase  28.27 
 
 
781 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2986  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  26.86 
 
 
804 aa  345  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.948588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0124  phosphoprotein phosphatase  29.78 
 
 
824 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0227  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  27.97 
 
 
851 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273525  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0093  phosphoprotein phosphatase  28.52 
 
 
824 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0078  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.38 
 
 
833 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2789  stage II sporulation protein E  24.1 
 
 
796 aa  286  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0085  phosphoprotein phosphatase  29.55 
 
 
806 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2475  stage II sprulation protein E, putative  24.36 
 
 
796 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.461942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00550  Serine/threonine specific protein phosphatase spoIIE  26.01 
 
 
790 aa  248  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00773403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2061  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  26.42 
 
 
792 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0138  protein serine/threonine phosphatase  27.18 
 
 
527 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0217  protein serine/threonine phosphatase  25.76 
 
 
764 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0103  serine phosphatase  34.18 
 
 
680 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0143  protein serine/threonine phosphatase  23.66 
 
 
697 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000162772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  26.11 
 
 
566 aa  74.7  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  23.87 
 
 
262 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  26.09 
 
 
455 aa  67  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  25.48 
 
 
451 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  23.81 
 
 
570 aa  61.6  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 
453 aa  62  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  28.44 
 
 
687 aa  61.2  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.33 
 
 
606 aa  60.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  24.14 
 
 
708 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.17 
 
 
480 aa  58.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  25.12 
 
 
633 aa  57.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.15 
 
 
590 aa  57.4  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.17 
 
 
516 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1584  stage II sporulation E family protein  28.32 
 
 
383 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00248045  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  26.8 
 
 
642 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  21.95 
 
 
434 aa  55.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  24.22 
 
 
708 aa  54.7  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.19 
 
 
421 aa  54.7  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  24.76 
 
 
470 aa  53.9  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.08 
 
 
1017 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  28.69 
 
 
464 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  23.94 
 
 
1087 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  25.24 
 
 
715 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.51 
 
 
579 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  25.79 
 
 
400 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  23.03 
 
 
706 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1021  putative PAS/PAC sensor protein  28.36 
 
 
564 aa  52.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.83 
 
 
389 aa  52.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  25.79 
 
 
649 aa  52.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.11 
 
 
616 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1246  putative PAS/PAC sensor protein  21.43 
 
 
508 aa  52.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  24.57 
 
 
377 aa  52  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  23.68 
 
 
418 aa  52  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.11 
 
 
655 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  27.36 
 
 
688 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  25.54 
 
 
400 aa  51.6  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  21.74 
 
 
612 aa  51.6  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  26.79 
 
 
415 aa  51.2  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  23.21 
 
 
1079 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2104  stage II sporulation E family protein  22.01 
 
 
333 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799939  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2141  stage II sporulation E family protein  22.01 
 
 
333 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2012  Stage II sporulation E family protein  19.91 
 
 
612 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  21.66 
 
 
1004 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  22.38 
 
 
361 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02070  Stage II sporulation E family protein  29.81 
 
 
384 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  25.55 
 
 
492 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  22.93 
 
 
644 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  23.29 
 
 
1087 aa  50.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01780  Serine/threonine specific protein phosphatase  22.84 
 
 
391 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.29 
 
 
1248 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  25.36 
 
 
467 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  23.88 
 
 
775 aa  49.3  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  25.14 
 
 
418 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  22.67 
 
 
532 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  23.33 
 
 
423 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.01 
 
 
684 aa  48.9  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  24.49 
 
 
648 aa  48.9  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  25.85 
 
 
410 aa  48.5  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  27.61 
 
 
445 aa  48.5  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1283  protein serine/threonine phosphatase  22.22 
 
 
235 aa  48.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00412718  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  22.79 
 
 
683 aa  47.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  26.38 
 
 
445 aa  47.8  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  24.52 
 
 
584 aa  47.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1680  sigma factor B regulator protein  22.01 
 
 
333 aa  47.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0672  RsbU-like serine phosphatase, regulator of sigma subunit  22.64 
 
 
254 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0112  protein serine/threonine phosphatase  22.73 
 
 
251 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193496  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4047  protein serine/threonine phosphatase  24.37 
 
 
391 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.448973  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2299  protein serine/threonine phosphatase  26.18 
 
 
390 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.12742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  23.11 
 
 
509 aa  47.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  23.13 
 
 
658 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>