71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2475 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2475  stage II sprulation protein E, putative  100 
 
 
796 aa  1592    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.461942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2789  stage II sporulation protein E  96.36 
 
 
796 aa  1521    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2681  serine phosphatase  28.29 
 
 
798 aa  348  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0790  phosphoprotein phosphatase  29.33 
 
 
781 aa  337  7e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2986  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  27.83 
 
 
804 aa  318  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.948588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0124  phosphoprotein phosphatase  28.38 
 
 
824 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0195  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  25.61 
 
 
821 aa  280  7e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  24.3 
 
 
826 aa  270  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0059  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  27.05 
 
 
826 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00270426  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0085  phosphoprotein phosphatase  26.92 
 
 
806 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0093  phosphoprotein phosphatase  25.61 
 
 
824 aa  254  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  24.23 
 
 
823 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0227  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  25.96 
 
 
851 aa  246  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273525  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0069  stage II sporulation protein E  24.48 
 
 
823 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00552781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5247  stage II sporulation protein E  24.35 
 
 
823 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0104377  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0060  stage II sporulation protein E  24.38 
 
 
792 aa  244  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00425059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0073  stage II sporulation protein E  24.38 
 
 
823 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00108149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0061  stage II sporulation protein E  24.12 
 
 
792 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000183348  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  24.12 
 
 
792 aa  242  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  24.12 
 
 
808 aa  242  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0061  stage II sporulation protein E  24.12 
 
 
808 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0070  stage II sporulation protein E  24.12 
 
 
823 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2061  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  25.56 
 
 
792 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0057  sporulation stage II protein E  25.35 
 
 
815 aa  238  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0078  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  26.37 
 
 
833 aa  225  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00550  Serine/threonine specific protein phosphatase spoIIE  24.12 
 
 
790 aa  210  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00773403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0138  protein serine/threonine phosphatase  26 
 
 
527 aa  173  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0217  protein serine/threonine phosphatase  24.92 
 
 
764 aa  156  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0103  serine phosphatase  29.95 
 
 
680 aa  147  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0143  protein serine/threonine phosphatase  30.71 
 
 
697 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000162772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  29.27 
 
 
413 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  29.27 
 
 
413 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  29.27 
 
 
413 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  24.54 
 
 
377 aa  57.8  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  27.14 
 
 
464 aa  56.6  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1283  protein serine/threonine phosphatase  26.07 
 
 
235 aa  55.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00412718  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  24.11 
 
 
570 aa  54.3  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  29.03 
 
 
423 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  22.93 
 
 
400 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0112  protein serine/threonine phosphatase  23.64 
 
 
251 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193496  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.15 
 
 
606 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1584  stage II sporulation E family protein  25.11 
 
 
383 aa  51.6  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00248045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4565  stage II sporulation E family protein  25.79 
 
 
252 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.446834  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02070  Stage II sporulation E family protein  25.69 
 
 
384 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  28.37 
 
 
568 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  26.4 
 
 
393 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  18.51 
 
 
516 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.75 
 
 
391 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  26.17 
 
 
715 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.56 
 
 
389 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  24.77 
 
 
453 aa  48.5  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2489  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase and phosphatase)  21.86 
 
 
330 aa  48.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  24.54 
 
 
405 aa  47.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.83 
 
 
590 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2141  stage II sporulation E family protein  23.98 
 
 
333 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2104  stage II sporulation E family protein  23.98 
 
 
333 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.31 
 
 
421 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  26.15 
 
 
391 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3700  serine phosphatase  23.97 
 
 
385 aa  46.6  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  21.95 
 
 
451 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  22.65 
 
 
612 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  25.52 
 
 
488 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  23.66 
 
 
418 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  23.66 
 
 
400 aa  45.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  23.79 
 
 
373 aa  45.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.76 
 
 
480 aa  45.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  25 
 
 
262 aa  44.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
560 aa  44.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2299  protein serine/threonine phosphatase  25.24 
 
 
390 aa  44.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.12742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  22.39 
 
 
566 aa  44.3  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  30.71 
 
 
568 aa  44.3  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>