102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2681 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2681  serine phosphatase  100 
 
 
798 aa  1622    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2986  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  49.44 
 
 
804 aa  853    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.948588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0790  phosphoprotein phosphatase  35.78 
 
 
781 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0124  phosphoprotein phosphatase  30.66 
 
 
824 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0227  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  31.23 
 
 
851 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273525  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0085  phosphoprotein phosphatase  30.79 
 
 
806 aa  350  6e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0093  phosphoprotein phosphatase  29.9 
 
 
824 aa  348  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2789  stage II sporulation protein E  27.41 
 
 
796 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0057  sporulation stage II protein E  29.11 
 
 
815 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0069  stage II sporulation protein E  28.05 
 
 
823 aa  335  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00552781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5247  stage II sporulation protein E  28.05 
 
 
823 aa  334  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0104377  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2475  stage II sprulation protein E, putative  28.17 
 
 
796 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.461942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  27.79 
 
 
823 aa  332  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0073  stage II sporulation protein E  28.05 
 
 
823 aa  330  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00108149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0060  stage II sporulation protein E  28.05 
 
 
792 aa  330  9e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00425059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0061  stage II sporulation protein E  28.12 
 
 
808 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  28.12 
 
 
808 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  28.05 
 
 
792 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0061  stage II sporulation protein E  27.92 
 
 
792 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000183348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0070  stage II sporulation protein E  27.92 
 
 
823 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.59 
 
 
826 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0059  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  29.23 
 
 
826 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0195  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.02 
 
 
821 aa  313  9e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2061  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  27.11 
 
 
792 aa  295  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0138  protein serine/threonine phosphatase  33.76 
 
 
527 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0078  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  25.45 
 
 
833 aa  272  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00550  Serine/threonine specific protein phosphatase spoIIE  26.29 
 
 
790 aa  238  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00773403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0143  protein serine/threonine phosphatase  24.65 
 
 
697 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000162772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0217  protein serine/threonine phosphatase  26.31 
 
 
764 aa  180  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0103  serine phosphatase  34.26 
 
 
680 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  26.09 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  25 
 
 
451 aa  64.3  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1701  protein serine/threonine phosphatase  22.37 
 
 
253 aa  63.9  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  23.53 
 
 
400 aa  61.6  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  23.79 
 
 
410 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  22.6 
 
 
512 aa  58.9  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  25.36 
 
 
249 aa  57.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  23.88 
 
 
708 aa  57.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  25.36 
 
 
642 aa  57.4  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.12 
 
 
590 aa  57.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0112  protein serine/threonine phosphatase  22.52 
 
 
251 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193496  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3169  protein serine/threonine phosphatase  20.09 
 
 
238 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00870401  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  25.37 
 
 
706 aa  55.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  22 
 
 
648 aa  55.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  22.55 
 
 
453 aa  54.7  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3323  serine phosphatase  23.08 
 
 
550 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3385  stage II sporulation E family protein  23.08 
 
 
550 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.0708395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3334  stage II sporulation E family protein  23.08 
 
 
550 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2618  putative PAS/PAC sensor protein  26.34 
 
 
685 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  22.27 
 
 
423 aa  53.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  28.1 
 
 
464 aa  53.5  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  26.35 
 
 
406 aa  53.5  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.96 
 
 
655 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  24.11 
 
 
550 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  22.55 
 
 
1087 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  23.92 
 
 
1087 aa  52  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4565  stage II sporulation E family protein  22.17 
 
 
252 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.446834  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0803  protein serine/threonine phosphatase  23.56 
 
 
246 aa  52  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  23.32 
 
 
445 aa  50.8  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  25.44 
 
 
412 aa  50.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  26.07 
 
 
262 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1584  stage II sporulation E family protein  23.64 
 
 
383 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00248045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  21.15 
 
 
377 aa  49.7  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  21.5 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  22.89 
 
 
445 aa  50.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  23.35 
 
 
389 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  24.84 
 
 
705 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  23.86 
 
 
389 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  24.02 
 
 
716 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  27.18 
 
 
516 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.97 
 
 
572 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  20.87 
 
 
644 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  21.43 
 
 
434 aa  48.9  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  22.55 
 
 
687 aa  48.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.44 
 
 
606 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  26.09 
 
 
429 aa  48.5  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  20.3 
 
 
365 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01780  Serine/threonine specific protein phosphatase  25.44 
 
 
391 aa  48.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  25 
 
 
414 aa  48.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  22.93 
 
 
612 aa  47.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  21.66 
 
 
467 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  20.61 
 
 
418 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  24.07 
 
 
516 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02070  Stage II sporulation E family protein  25.65 
 
 
384 aa  47.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  22.05 
 
 
658 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  23 
 
 
633 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  25.5 
 
 
566 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  21.92 
 
 
393 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0392  serine phosphatase  21.66 
 
 
233 aa  45.8  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0288764  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1283  protein serine/threonine phosphatase  22.55 
 
 
235 aa  46.2  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00412718  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  23.28 
 
 
660 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  25.83 
 
 
509 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1123  sigma factor regulatory protein, putative  29.45 
 
 
561 aa  45.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  24.4 
 
 
412 aa  45.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.69 
 
 
421 aa  45.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  21.26 
 
 
581 aa  45.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  20.93 
 
 
418 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  21.8 
 
 
431 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  21.8 
 
 
431 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3464  protein serine/threonine phosphatase  24.53 
 
 
392 aa  44.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>