76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0093 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0093  phosphoprotein phosphatase  100 
 
 
824 aa  1674    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0124  phosphoprotein phosphatase  34.17 
 
 
824 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2681  serine phosphatase  29.72 
 
 
798 aa  356  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0790  phosphoprotein phosphatase  29.99 
 
 
781 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0227  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  29.95 
 
 
851 aa  348  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273525  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0085  phosphoprotein phosphatase  30.6 
 
 
806 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2986  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.71 
 
 
804 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.948588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2061  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  31.85 
 
 
792 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0195  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.19 
 
 
821 aa  300  6e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  27.74 
 
 
823 aa  298  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5247  stage II sporulation protein E  27.87 
 
 
823 aa  296  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0104377  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0069  stage II sporulation protein E  27.74 
 
 
823 aa  296  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00552781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0060  stage II sporulation protein E  28.13 
 
 
792 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00425059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0073  stage II sporulation protein E  28.13 
 
 
823 aa  294  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00108149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0057  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.53 
 
 
826 aa  294  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0061  stage II sporulation protein E  27.87 
 
 
792 aa  294  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000183348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0070  stage II sporulation protein E  27.87 
 
 
823 aa  293  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  27.74 
 
 
792 aa  293  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0061  stage II sporulation protein E  27.87 
 
 
808 aa  293  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0057  serine/threonine specific protein phosphatase; stage II sporulation protein E  27.87 
 
 
808 aa  293  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0057  sporulation stage II protein E  28.15 
 
 
815 aa  287  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0059  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  27.69 
 
 
826 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00270426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2789  stage II sporulation protein E  25.44 
 
 
796 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00550  Serine/threonine specific protein phosphatase spoIIE  28.62 
 
 
790 aa  251  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00773403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2475  stage II sprulation protein E, putative  25.61 
 
 
796 aa  249  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.461942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0078  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  24.81 
 
 
833 aa  213  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0138  protein serine/threonine phosphatase  27.56 
 
 
527 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0103  serine phosphatase  40.74 
 
 
680 aa  179  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0217  protein serine/threonine phosphatase  23.47 
 
 
764 aa  155  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0143  protein serine/threonine phosphatase  35.78 
 
 
697 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000162772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.18 
 
 
516 aa  68.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3169  protein serine/threonine phosphatase  24.41 
 
 
238 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00870401  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  27.04 
 
 
414 aa  61.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1283  protein serine/threonine phosphatase  22.34 
 
 
235 aa  59.3  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00412718  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  26 
 
 
451 aa  59.3  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0112  protein serine/threonine phosphatase  22.9 
 
 
251 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193496  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2299  protein serine/threonine phosphatase  23.33 
 
 
390 aa  57.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.12742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1584  stage II sporulation E family protein  26.15 
 
 
383 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00248045  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  27.14 
 
 
570 aa  54.7  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1701  protein serine/threonine phosphatase  24.26 
 
 
253 aa  54.3  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0656  stage II sporulation E family protein  26.21 
 
 
392 aa  53.9  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0317  stage II sporulation E family protein  25 
 
 
379 aa  53.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.45 
 
 
445 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.36 
 
 
572 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4565  stage II sporulation E family protein  23.5 
 
 
252 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.446834  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  24.83 
 
 
488 aa  52.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 
648 aa  51.6  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  24.26 
 
 
445 aa  51.2  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  26.61 
 
 
391 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3169  protein serine/threonine phosphatase  26.96 
 
 
192 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.822146  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01780  Serine/threonine specific protein phosphatase  25 
 
 
391 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1021  putative PAS/PAC sensor protein  29.32 
 
 
564 aa  49.7  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  23.11 
 
 
693 aa  49.3  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1358  protein serine/threonine phosphatase  27.87 
 
 
372 aa  48.5  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  23.31 
 
 
645 aa  48.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0751  protein serine/threonine phosphatase  22.86 
 
 
390 aa  48.1  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.298345  hitchhiker  0.00000000000976918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  32.63 
 
 
563 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  27.41 
 
 
560 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02070  Stage II sporulation E family protein  28.14 
 
 
384 aa  47  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  31.15 
 
 
464 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  21.29 
 
 
644 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 
512 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  28.48 
 
 
683 aa  47  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  20.2 
 
 
400 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  24.67 
 
 
708 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  25.89 
 
 
568 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  25.34 
 
 
393 aa  45.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  26.7 
 
 
642 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  27.94 
 
 
543 aa  45.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.63 
 
 
655 aa  45.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 
337 aa  44.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  25.24 
 
 
631 aa  44.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  22.27 
 
 
694 aa  44.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0091  protein serine/threonine phosphatase  23.92 
 
 
390 aa  44.3  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  29.19 
 
 
393 aa  44.3  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  23.47 
 
 
445 aa  44.3  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>