More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0097 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0097  twitching motility protein  100 
 
 
357 aa  731    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.767539  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  50.73 
 
 
351 aa  339  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  48.28 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  48.72 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  47.7 
 
 
350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  48.28 
 
 
351 aa  334  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  44.76 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  46.72 
 
 
351 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  46.02 
 
 
344 aa  315  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  46.13 
 
 
375 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  47.43 
 
 
360 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  45.83 
 
 
360 aa  309  5e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  45.3 
 
 
372 aa  309  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  45.22 
 
 
352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  47.28 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  47.34 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  47.48 
 
 
368 aa  299  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  43.87 
 
 
365 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  46.99 
 
 
367 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  43.48 
 
 
365 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  43.85 
 
 
362 aa  296  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  46.73 
 
 
370 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  46.55 
 
 
345 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  46.75 
 
 
344 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  45.53 
 
 
378 aa  292  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  42.74 
 
 
365 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  42.41 
 
 
360 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  45.72 
 
 
344 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  45.72 
 
 
344 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  43.18 
 
 
366 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  46.75 
 
 
344 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  43.47 
 
 
365 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  46.31 
 
 
344 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0871  putative protein transport, PilT-like  42.9 
 
 
378 aa  289  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  44.57 
 
 
397 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  44.32 
 
 
362 aa  289  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  43.84 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  46.15 
 
 
366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  43.87 
 
 
368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  43.18 
 
 
366 aa  289  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  46.15 
 
 
366 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  45.72 
 
 
344 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  44.54 
 
 
345 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  43.28 
 
 
348 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  45.05 
 
 
351 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  46.06 
 
 
370 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  45.09 
 
 
360 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  45.85 
 
 
366 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  44.15 
 
 
347 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  43.02 
 
 
430 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  42.78 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  43.63 
 
 
356 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  45.85 
 
 
365 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  46.29 
 
 
347 aa  285  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  44.13 
 
 
350 aa  285  9e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  43.5 
 
 
345 aa  285  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  42.3 
 
 
360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  44.14 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  44.96 
 
 
345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  42.17 
 
 
358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  43.84 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  43.79 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  44.29 
 
 
345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  42.25 
 
 
360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  43.84 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  43.91 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  44.19 
 
 
344 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  43.59 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  43.79 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  43.79 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  44.04 
 
 
363 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  44.15 
 
 
382 aa  282  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  43.79 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  43.59 
 
 
344 aa  282  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  43.02 
 
 
357 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  44.54 
 
 
344 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  42.29 
 
 
356 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  44.64 
 
 
347 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  43.68 
 
 
345 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  44.7 
 
 
344 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  44.67 
 
 
437 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  44.54 
 
 
344 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  43.07 
 
 
358 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  44.83 
 
 
427 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  43.63 
 
 
345 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  43.68 
 
 
345 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  41.43 
 
 
360 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  44.35 
 
 
346 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  44.54 
 
 
427 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  44.35 
 
 
388 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  45.77 
 
 
344 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  43.68 
 
 
345 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  43.68 
 
 
345 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  44.54 
 
 
427 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  43.22 
 
 
356 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  43.5 
 
 
345 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  46.83 
 
 
347 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  44.05 
 
 
346 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  43.23 
 
 
345 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  43.27 
 
 
347 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>