More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1604 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 399 aa  786    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  48.28 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  50.28 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  46.7 
 
 		 413 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  45.38 
 
 		 461 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  46.72 
 
 		 406 aa  342  5.999999999999999e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  44 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  44.63 
 
 		 410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  44.9 
 
 		 533 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  45.05 
 
 		 530 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  46.98 
 
 		 594 aa  322  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  46.98 
 
 		 594 aa  322  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  44.81 
 
 		 533 aa  322  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  46.59 
 
 		 415 aa  322  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  44.59 
 
 		 535 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  44.39 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  44 
 
 		 530 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  42.89 
 
 		 532 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  42.89 
 
 		 532 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  43.85 
 
 		 532 aa  316  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  44.35 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  44.69 
 
 		 534 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  45.09 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  44.13 
 
 		 533 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  43.98 
 
 		 533 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  43.7 
 
 		 531 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  46.04 
 
 		 533 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  49.72 
 
 		 411 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.99 
 
 		 848 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.26 
 
 		 849 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  42.42 
 
 		 533 aa  309  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  40.32 
 
 		 470 aa  309  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.85 
 
 		 856 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  45.06 
 
 		 533 aa  308  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  42.67 
 
 		 533 aa  308  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  47.31 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  42.42 
 
 		 532 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  44.82 
 
 		 531 aa  305  9.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  43.14 
 
 		 532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  41.56 
 
 		 530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  42.47 
 
 		 554 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 		 761 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  42.13 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  43.67 
 
 		 532 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  41.33 
 
 		 554 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  41.33 
 
 		 554 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  42.45 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  44.44 
 
 		 534 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  43.14 
 
 		 735 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  42.19 
 
 		 533 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  39.55 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.92 
 
 		 839 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  42.22 
 
 		 554 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.22 
 
 		 845 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  42.61 
 
 		 533 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  45.26 
 
 		 533 aa  296  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  40.27 
 
 		 554 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  40.27 
 
 		 554 aa  295  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.94 
 
 		 844 aa  295  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.81 
 
 		 853 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  44.19 
 
 		 534 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  39 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  39 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  43.23 
 
 		 526 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  41.88 
 
 		 556 aa  292  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  37.11 
 
 		 461 aa  292  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.38 
 
 		 844 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  43.06 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  39.91 
 
 		 503 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  41.73 
 
 		 529 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  43.34 
 
 		 533 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  43.14 
 
 		 534 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  43.43 
 
 		 534 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  41.71 
 
 		 512 aa  286  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.09 
 
 		 856 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  41.76 
 
 		 843 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  38.52 
 
 		 474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  37.81 
 
 		 419 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  40.51 
 
 		 471 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  40.32 
 
 		 531 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  37.81 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  42.52 
 
 		 526 aa  281  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  42.78 
 
 		 532 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  42.78 
 
 		 532 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.97 
 
 		 834 aa  280  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  41.16 
 
 		 510 aa  280  4e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  41.04 
 
 		 759 aa  277  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.67 
 
 		 756 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  39.79 
 
 		 521 aa  276  4e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  40.92 
 
 		 521 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  40.41 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  37.06 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.2 
 
 		 844 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  38.25 
 
 		 535 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  40.05 
 
 		 748 aa  272  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  43.09 
 
 		 502 aa  273  6e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  43.47 
 
 		 501 aa  268  1e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  38.9 
 
 		 532 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.3 
 
 		 753 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  38.73 
 
 		 740 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>