More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1457 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  100 
 
 		 172 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  40.72 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1460  shikimate kinase  37.72 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00429425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  39.52 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  36.26 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  38.82 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  37.06 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  35.67 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  35.67 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  40 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  32.75 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  37.11 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  39.41 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  37.72 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  33.72 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  35.71 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0792  Shikimate kinase  40.56 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.5919e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  31.84 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  38.37 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  35.47 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  35.67 
 
 		 192 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  38.6 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0696  shikimate kinase  36.71 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  36.36 
 
 		 180 aa  103  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  34.12 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  38.92 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  34.91 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  37.58 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  36.36 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  35.12 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  36.31 
 
 		 181 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  35.84 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  35.47 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  34.55 
 
 		 209 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 539 aa  101  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  34.55 
 
 		 199 aa  101  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  34.55 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  36.9 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  33.13 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0168  shikimate kinase  34.3 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00656319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  33.75 
 
 		 182 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  34.55 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  34.55 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  34.55 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  34.55 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  35.12 
 
 		 195 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  33.14 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  34.55 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  36.09 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  35.93 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  36.13 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  35.67 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  37.87 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  37.95 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  36.69 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  36.09 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 593 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  39.63 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2181  Shikimate kinase  33.79 
 
 		 202 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  37.99 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  36.9 
 
 		 197 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0410  shikimate kinase  39.63 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  36.09 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  36.02 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  34.97 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  36.99 
 
 		 190 aa  99  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  34.5 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  34.73 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06600  shikimate kinase  35.12 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  35.5 
 
 		 183 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  34.91 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  34.3 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  35.58 
 
 		 163 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  34.52 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  34.73 
 
 		 181 aa  98.2  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  35.12 
 
 		 186 aa  97.8  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  39.02 
 
 		 165 aa  97.8  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  35.12 
 
 		 172 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  38.69 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  37.35 
 
 		 172 aa  97.4  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  36.81 
 
 		 183 aa  97.4  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  35.09 
 
 		 184 aa  97.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  37.28 
 
 		 185 aa  97.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  34.52 
 
 		 186 aa  97.4  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2092  shikimate kinase II  32 
 
 		 175 aa  97.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300334  normal  0.0606791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  32.93 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01390  shikimate kinase  35.85 
 
 		 185 aa  97.4  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0631  shikimate kinase  39.07 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0688988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  35.12 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  35.54 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  31.98 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  36.97 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  33.33 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0694  shikimate kinase  36.2 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.233345  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  37.5 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  35.67 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  36.14 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  36.14 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  35.76 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  35.76 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>