More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0631 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0631  shikimate kinase  100 
 
 		 170 aa  343  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0688988  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0696  shikimate kinase  57.14 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  41.32 
 
 		 181 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  38.89 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  38.89 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  39.07 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1906  shikimate kinase  38.41 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  34.73 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  38.41 
 
 		 532 aa  92  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1460  shikimate kinase  36.14 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00429425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.35 
 
 		 539 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  34.97 
 
 		 454 aa  89  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  35.33 
 
 		 169 aa  87.4  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  33.72 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  38.16 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  35.85 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  35.85 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  33.72 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0768  Shikimate kinase  34.39 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  37.09 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  35.09 
 
 		 192 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  39.04 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  34.34 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  37.13 
 
 		 458 aa  84.3  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  31.93 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  34.5 
 
 		 198 aa  84  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  36.9 
 
 		 168 aa  84  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  38.27 
 
 		 172 aa  84  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  35.03 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1596  shikimate kinase  33.75 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0865399  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  34.5 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  32.14 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  35.54 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1629  shikimate kinase  33.75 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.682402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  30.63 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  32.53 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  37.27 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  37.5 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  36.67 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  37.04 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  36.67 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  36.67 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  36.67 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  36.67 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  36.05 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  36.67 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  33.33 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  36.67 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  33.14 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  37.34 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  33.53 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  33.33 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  37.42 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  36 
 
 		 199 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  31.71 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  34.78 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  29.65 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2922  shikimate kinase II  32.32 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  31.9 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  32.52 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  35.4 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  33.33 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  35.58 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0086  Shikimate kinase  36.3 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.744352  hitchhiker  0.00173966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  37.09 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  34.16 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  32.56 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  38 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  29.07 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  33.33 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  29.07 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  30.99 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  37.58 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  33.97 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  32.72 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  32.14 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  34.76 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0997  shikimate kinase II  29.52 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.287041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  32.53 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  34 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  36.91 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  36.3 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3313  shikimate kinase II  30.3 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  31.41 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  31.14 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  32.16 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  33.14 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  31.4 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  31.79 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  30.41 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  37.75 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  32.35 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2605  shikimate 5-dehydrogenase  34.87 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0320  shikimate kinase  38.36 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  31.79 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2715  shikimate kinase  37.93 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  32.35 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>